基因组学补充—吴江昊.docVIP

（根据于军老师的文献总结）基因组学研究的特点： 基因组学研究包括对基因产物(转录子组、蛋白质组，代谢组等) 的系统性研究, 也必然要上升到细胞学过程, 及其分子生物学机制和系统生物学的水平； 基因组作为信息载体，它所储存的信息是最基本的生物学信息之一；既是生命本质研究的出发点之一，又是生物信息的归宿。 基因组学就其研究规模而言 是一门大科学： 首先基因组的信息含量高, 而基因组学的研究又在于基因组间的比较, 因此所需要和产出的信息更多。 其次, 基因组研究所总结的规律多具有普遍意义, 基因组的信息是用来发现和解释具有普遍意义的生命现象和它们的变化、内在规律和相互关系。 再者, 基因组学研究的深入和展开是学科交叉合作成为必然。基因组学的复杂性必然导致多学科概念和技术的引进和介人。 实验数据的规模化产出。基因组信息主要来自于高效率和规模化的技术平台, 所谓的”信息生产线”； 5.基因组学研究将不断造就新技术和新领域, 因为基因组学研究的手段和技术已经走在生命科学研究的最前沿。 6.基因组学最根本的力量是它获取信息的可计划性和彻底性； 另一种答案： 1.基因组学一改传统“ 模型导向”的研究模式, 凸现其“ 数据导向”的特点； 2.基因组学研究的另外一个突出的特点是它的系统性。这里包括获取数据的系统性和生物学研究的系统性。没有比获取生物体的全部基因顺序更系统化的研究方式了 3.基因组学研究还有一个突出的特点, 那就是合作性。所有的生命体都有基因组, 而基因组研究并不能取代其它生物学科的研究。学科间的沟通和合作是必然的。基因组学除了提供最基本的遗传信息外, 还可以为基因功能的研究提供指导性的建议。 核酸组分异质性（GC含量） ①真核生物基因内核酸组分变化与基因的长度、结构、生殖细胞中的 表达水平等许多基因参数有关。 ②基因内的GC 含量从转录起始点开始，沿着转录方向呈现出明显的下降梯度，在转录起始点尤为显著，甚至排除掉启动子区域的CpG 二核苷酸的影响也是如此；温血脊椎动物和单子叶植物基因呈现出这种明显且保守的GC 含量下降梯度，而冷血脊椎动物、非脊椎动物和双子叶植物则不然。 ③GC 含量下降梯度可能存在于基因的所有区域，例如内含子、编码外显子和非编码外显子，但GC 含量变化范围不同，例如，外显子GC 含量高于内含子和编码区GC 含量高于非编码区。这种区域内不均一的GC 含量使得GC 含量谱在整个基因转录区域呈现出高度下降的GC 含量峰值被长距离的低GC 所中断。 ④基因内GC 含量变化还与生殖细胞中的基因表达水平有关。与低表达基因相比，高表达基因具有更为倾斜的GC 含量梯度，在转录起始点的GC 含量峰值更为显著。基于这些发现，我们推测基因内核酸组分可能至少是突变偏好、转录偶联修复、自然选择三个因素共同作用的结果，而且转录偶联修复起主要作用。 基因组学研究内容： 基因组研究应该包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学(struc　tural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics结构基因组学代表基因组分析的早期阶段，以建立生物体高分辨率遗传、物理和转录图谱为主。结构基因组学(structural genomics)是基因组学的一个重要组成部分和研究领域，它是一门通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。遗传信息在染色体上，但染色体不能直接用来测序，必须将基因组这一巨大的研究对象进行分解，使之成为较易操作的小的结构区域，这个过程就是基因作图。根据使用的标志和手段不同，作图有三种类型，即构建生物体基因组高分辨率的遗传图谱、物理图谱、转录图谱功能基因组学代表基因分析的新阶段，是利用结构基因组学提供的信息系统地研究基因功能，它以高通量、大规模实验方法以及统计与计算机分析为特征功能基因组学(functional genomics)又往往被称为后基因组学(postgenomics)，它利用结构基因组所提供的信息和产物，发展和应用新的实验手段，通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能，使得生物学研究从对单一基因或蛋白质的研究转向多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。这是在基因组静态的碱基序列弄清楚之后转入基因组动态的生物学功能学研究［3］。研究内容包括基因功能发现、基因表达分析及突变检测 （HGP的发展阶段）　　1983年和1984年美国DOE（能源部）和NIH（卫生总署）分别组织了相关领域科学家，进行了启动大规模人类基因组测序计划可能性的研讨，这就是HGP的酝酿阶段[1,2]。有几位科学家这两个会议都参加了，比如目前仍是美国系统生物学研究所所长的胡德博士（Leroy E. Hood）和华盛顿大学退休教授欧森博士（Maynard V. Olson）。胡德博士领导的