miRNA-156基因家族进化及功能分析..doc

本 科 毕 业 论 文 miRNA-156基因家族进化及功能分析 姓名 *** 院系 生命科学学院 专业 生物技术 年级 2011级 学号 2011******* 指导教师 王艳芳 讲师 2015年5月20日 独 创 声 明 本人郑重声明：所呈交的毕业论文(设计)，是本人在指导老师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果，成果不存在知识产权争议。尽我所知，除文中已经注明引用的内容外，本论文（设计）不含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体均已在文中以明确方式标明。 此声明的法律后果由本人承担。 作者签名:二年 月 日 毕业论文（设计）使用授权声明 本人完全了解鲁东大学关于收集、保存、使用毕业论文（设计）的规定。 本人愿意按照学校要求提交论文（设计）的印刷本和电子版，同意学校保存论文（设计）的印刷本和电子版，或采用影印、数字化或其它复制手段保存论文（设计）；同意学校在不以营利为目的的前提下，建立目录检索与阅览服务系统，公布论文（设计）的部分或全部内容，允许他人依法合理使用。 （保密论文在解密后遵守此规定） 作者签名:二年 月 日 *** 性别 男 学院 生命科学学院 年级 生技本1101 学号 2011******* 题 目 miRNA-156基因家族进化及功能分析 课题来源 教师推荐 课题类别 理论研究 MiRNA-156基因家族进化及功能分析，是系统的对miRNA-156基因家族进行对比预测及研究，由此推测该家族的基因可能以不同的方式和速度进化的，并且通过靶基因预测看与转录因子结合情况,分析参与多种胁迫应答反应情况，本文可为全面深人研究miRNA的作用机制奠定基础也可为全面剖析miRNA调控机理提供新的思路。 主要参考文献目录： Dennis C. The brave new world of RNA. Nature 2002; 418(6894):122-4. Zhang BH,PanXP,CannonCH,etal.Conservation and divergence of plant mieroRNA genes [J] Plant J,2006,46(2):243一259. Reinhart B J,Weinstein E G,Rhoades M W,et al.Miero RNAs in plants[J]. Genes Dev, 2002,16 616一1626 丁艳菲,王光钺,傅亚萍,朱诚。miR398在植物逆境胁迫应答中的作用DOI:10.3724/SP.J. 1005.2010.00129 本次研究通过对在所有植物miRNA-156基因家族成员的成熟序列进行多重序列对比，构建系统进化树分析，然后选取代表性的三个物种的miR398基因进行靶基因预测。 从而确定相对保守的碱基的位置，通过得到的系统进化树图进行分析，此而得到miRNA-156前体在序列上的多样性,也从侧面反映了植物的RNA前体的复杂性，由此推测该家族的基因可能以不同的方式和速度进化而来。通过靶基因预测了解其在生命活动中的作用. 本研究可为系统挖掘miRNA-156的抗逆反应机制奠定基础,也可为全面剖析miRNA调控机理提供新的思路。 首先从数据库miRBase 中下载全部植物的miRNA-156基因家族所有成员的基因前体序列和成熟序列。通过相应软件对已搜索的植物物种的miRNA-156的成熟及前体序列进行多重序列比对，分析其进化的特征，然后在这个基础上利用软件进行分析分析对成熟序列构建系统进化树。并通过靶基因预测软件对选的三个物种的靶基因进行预测及分析。 可能遇到的问题是软件不会用，有的靶基因预测没有结果。 研究过程中，有的软件不会使用，通过老师同学的帮助学会使用，没有预测结果的就看情况舍弃。 miRNA-156基因家族进化及功能分析主要利用生物信息学手段来分析及预测miRNA398。为全面深人研究miRNA的作用机制奠定基础也为全面剖析miRNA调控机理提供新的思路。 该生能够根据课题要求，独立自主地去完成课题。采用生物信息学方法来预测并分析植物miRNA-156基因家族进化及功能，对本次的研究原理、方法、目的、意义都掌握的比较深，并且积极查阅文献，对课题有深入了解，善于思考。该同学在查阅相关文献的基础上，制定出了miRNA-156基因家族进化及功能分析的研究方案。研究思路正确，方案可行，有望达到预期的效果。因此，同意开题实施。 签名： 年 月 日 院（系）毕业论文（设计）领导小组意见： 同 意 开 题