微软用户-蛋白质芯片研究进展.pptVIP

蛋白质芯片研究进展 高 雁 指导老师：林炳承 研究员 内容提要 蛋白质芯片概述 蛋白质芯片的关键技术 蛋白质芯片的应用 展望 蛋白质芯片的定义 研究蛋白质芯片的意义 蛋白质是基因表达的最终产物, 接近生命活动的物质层面； 探针蛋白特异性高、亲和力强, 可简化样品前处理，甚至可直接利用生物材料(血样、尿样、细胞及组织等)进行检测； 适合高通量筛选与靶蛋白作用的化合物； 有助于了解药物或毒物与其效应相关蛋白质的相互作用。 蛋白质芯片的分类 蛋白质检测芯片 蛋白质功能芯片 蛋白质芯片的关键技术 蛋白质芯片的制备 固相载体及其处理 载体（滴定板、滤膜、凝胶、载玻片） 蛋白质的预处理 选择具有较高纯度和完好生物活性的蛋白进行溶解 点制微阵列 可使用点制基因微阵列的商品化点样仪或喷墨法等 蛋白质芯片比较 蛋白质芯片检测 蛋白质芯片的应用 疾病诊断和预警 药物开发 蛋白质组学 定量检测组织提取液中的肿瘤标记物 高通量筛选蛋白-蛋白作用抑制剂 人动脉平滑肌细胞蛋白谱 存在的问题 成本过高, 需一系列昂贵的尖端仪器 芯片的标准化问题 提高芯片的特异性、简化样品制备和标记操作程序、增加信号检测的灵敏度和消除芯片背景对于结果分析的影响等等 展望—蛋白质芯片未来的发展重点 建立快速、廉价、高通量的蛋白质表达和纯化方法，高通量制备抗体并定义每种抗体的亲和特异性。  改进基质材料的表面处理技术以减少蛋白质的非特异性结合。 提高芯片制作的点阵速度；提供合适的温度和湿度以保持芯片表面蛋白质的稳定性及生物活性。 研究通用的高灵敏度、高分辨率检测方法，实现成像与数据分析一体化。 ??? 参考文献 [1] Markus F, et al., DDT, 2002, 7,815-822. [2] Bertone P,et al., FEBS Journal, 2005, 272 , 5400–5411. [3] Poetz O et. al, Mechanisms of geing and Development, 2005, 126 ,161–170. [4] 李瑶，基因芯片与功能基因组，2004，32-33 [5] Zhu H et.al, Current Opinion in chemical Biology, 2003,755-63. [6] Weissenstein U, Proteomics 2006, 6, 1427–1436. [7] Fang Y，et al., ChemBioChem 2002, 3, 987- 991. [8] Sukhanov S and Delafontaine P，Proteomics, 2005, 5, 1274–1280. [9] Jung SO, et al., Proteomics 2005, 5, 4427–4431. [10] Schena M, Protein microarrays,2005, 7. 蛋白质芯片检测信号的提高 Protein Microarray System The Protein Microarray System is a complete microarray platform that includes microarray manufacturing, processing, surface chemistry, detection and analysis. G-蛋白偶联受体芯片 SELDI把基质改为 * Seminar I 生 物 芯 片 基因芯片 蛋白质芯片 微流控芯片 蛋白质芯片, 又称蛋白质阵列或蛋白质微阵列，是指以蛋白质分子作为配基,将其有序地固定在固相载体的表面形成微阵列；用标记了荧光的蛋白质或其他它分子与之作用，洗去未结合的成分，经荧光扫描等检测方式测定芯片上各点的荧光强度，来分析蛋白之间或蛋白与其它分子之间的相互作用关系。 / Markus F, et al., DDT, 2002, 7,815-822. Bertone P,et al., FEBS Journal, 2005, 272 , 5400–5411. Poetz O et. al, Mechanisms of geing and Development, 2005, 126 ,161–170. 提出生物学问题 （实验目的） 样品预处理 （重组蛋白，制备一、二级抗体， 荧光标记，配蛋白印记缓冲液） 生化反应 化学偶合，加底物， 反应温度和时间， 冲洗条件 检测 （荧光和比色扫描或拍照， 参数设置） 数据分析和建模 （图象量化，标准化， 采集蛋白信息，建立