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MATLAB并行运算测试效率评估.
MATLAB并行运算测试效果评估
1 MATLAB并行计算机制
MATLAB提供了并行计算工具箱(Parallel Computing Toolbox),可以将一个MATLAB会话(session,即client)的计算工作分配到其他的MATLAB会话(也称为worker)。在没有使用并行计算工具箱的情况下,MATLAB的计算工作是由client执行的;当使用了并行计算工具箱后,MATLAB能够创建多个worker(MATLAB确定了最大上限是8个),由client将计算工作分配到worker并行执行。
并行计算工具箱有三种典型的使用场景:
1、Parallel for-Loops (parfor):将for循环中的执行语句分配到不同的worker并行执行。要保证执行结果正确,需要保证for循环中的代码是能够彼此互不依赖。
Parfor实现的是代码级别的并行处理机制。
2、Batch Jobs:即批任务执行机制,一个worker负责一个job。一个任务通常是一个M文件或者一个函数。Batch Jobs实现的是任务(函数、文件为载体)级别的并行处理机制。
3、Large Data Sets:当处理的数据量太大超出内存负荷后,可以将此大数据分配到不同的worker,每一个worker只包含其中一部分数据,但是用户仍然可以将此大数据作为一个整体来操作。
本文评估了parfor工作效率。Parfor工作原理如下图所示,MATLAB client启动了3个worker来并行执行parfor中的代码,一个CPU核对应一个worker。本测试所用PC的CPU只有两个核,因此最多只能启动两个worker。
除了并行计算工具箱(Parallel Computing Toolbox),matlab还支持分布式计算引擎(MATLAB Distributed Computing Engine(Server),简称MDCE),可以扩展应用程序,将其应用到一个集群上的多台计算机,如下图所示。
本文基于MDCE在一个PC上创建job进行计算,一个job最多启动了10个worker进行并行计算。
2 parfor测试
2.1 测试环境
PC机硬件配置:
CPU:intel双核E4600 2.4GHz;
内存:2GB物理内存。
PC机操作系统:WINXP SP3。
MATLAB版本:7.9.0(R2009b)。
测试方法:执行fft计算,分别执行for循环的语句以及parfor循环的语句进行对比,for循环和parfor循环的代码完全一致,唯一区别的是for不是并行计算,而parfor启动了2个worker进行并行计算。
测试代码:
%%% 打开并行计算的工作资源池,1个资源池对应本地CPU的一个核。本机有两个核,取值为2。
testExamples = 5;
loopTimes = 1e5 ;
testStep = loopTimes;
tElapsed = [1:1:testExamples];
tElapsedPal = [1:1:testExamples];
Fs = 1000; % Sampling frequency
T = 1/Fs; % Sample time
L = 1000; % Length of signal
t = (0:L-1)*T; % Time vector
% Sum of a 50 Hz sinusoid and a 120 Hz sinusoid
x = 0.7*sin(2*pi*50*t) + sin(2*pi*120*t);
%% 非并行计算测试
isOpen = matlabpool(size);
if isOpen 0
matlabpool close;
end
for j=1:testExamples
timeStart = tic;
for i=1:loopTimes
y = x + 2*randn(size(t)); % Sinusoids plus noise
NFFT = 2^nextpow2(L); % Next power of 2 from length of y
Y = fft(y,NFFT)/L;
f = Fs/2*linspace(0,1,NFFT/2+1);
end
tElapsed(j) = toc(timeStart);
%% 增加循环次数
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