accessingthe s e e d servers getting started（accessingthe s e e d服务器开始）（156页）.docVIP

下载本文档

16
0
约24.67万字
约 156页
2017-01-23 发布于四川
举报
版权申诉

accessingthe s e e d servers getting started（accessingthe s e e d服务器开始）（156页）.doc

1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

* See Appendix for Current Seed teamGenome Annotation * See Appendix for Current Seed team Genome Annotation by The SEED Team* Table of Contents TOC \o 1-3 \h \z \u Introduction PAGEREF _Toc163549088 \h 8 The SEED Project PAGEREF _Toc163549089 \h 8 What is FIG? PAGEREF _Toc163549090 \h 8 The FIG Architecture: the SEED PAGEREF _Toc163549091 \h 9 Components of the SEED Annotation System PAGEREF _Toc163549092 \h 11 The SEED, the A-SEED, the P-SEED, and the PubSEED PAGEREF _Toc163549093 \h 11 SEED PAGEREF _Toc163549094 \h 11 Annotators SEED (A-SEED) PAGEREF _Toc163549095 \h 11 PATRIC SEED (P-SEED) PAGEREF _Toc163549096 \h 11 Public SEED (PubSEED) PAGEREF _Toc163549097 \h 11 What SEED Do I Use? PAGEREF _Toc163549098 \h 11 Ownership of Genomes PAGEREF _Toc163549099 \h 12 Setting Up an Annotation Group PAGEREF _Toc163549100 \h 15 Access of Data Via the Servers PAGEREF _Toc163549101 \h 15 Maintenance of Subsystems PAGEREF _Toc163549102 \h 16 Subsystems PAGEREF _Toc163549103 \h 17 FIGfams PAGEREF _Toc163549104 \h 17 RAST PAGEREF _Toc163549105 \h 18 Metabolic Modeling PAGEREF _Toc163549106 \h 19 Model Tutorials PAGEREF _Toc163549107 \h 19 Metagenomics PAGEREF _Toc163549108 \h 20 Annotating your Genome PAGEREF _Toc163549109 \h 21 Basic Steps in Annotating a Prokaryotic Genome PAGEREF _Toc163549110 \h 21 Running Your Genome Through RAST PAGEREF _Toc163549111 \h 21 Walking Your Genome PAGEREF _Toc163549112 \h 21 Building a Metabolic Reconstruction PAGEREF _Toc163549113 \h 22 Summary PAGEREF _Toc163549114 \h 23 Annotating a Genome Using RAST PAGEREF _Toc163549115 \h 23 Running Your Genome Through RAST PAGEREF _Toc163549116 \h 24 Walking your Genome Using RAST PAGEREF _Toc163549117 \h 24 Exporting Your Genome from RAST PAGEREF _Toc163549118 \h 29 Annotating a Genome with myRAST PAGEREF _Toc163549119 \h 29 Running a Genome Through myRAST PAGEREF _Toc163549120 \h 30 Walking your Genome Using myRAST PAGEREF _Toc163549121 \h 32 Exporting Your Genome