种群结构[精选].doc

用微卫星序列和线粒体DNA分析北美山猫种群区域结构 摘要 分析物种遗传多样性有利于广泛分布的野生动物物种保护。北美山猫（Lynx rufus）是广泛分布的猫科动物，其保护管理以州为单位进行。目前对其广泛分布范围内的遗传多样性知之甚少。本文检测了北美大陆分布范围内山猫的10个微卫星位点和线粒体控制区序列，分析了该物种的分化格局：两种标记都支持西部种群与中西部/东部种群在地质时期都曾经历了种群扩散，且中西部/东部种群的栖息范围经历了周期性的扩散-缩小变化；三个群体间存在明显分化，说明近期出现的障碍阻隔了群体间的基因流。结果警示：人口增长破坏了山猫赖以生存和加强基因流动的森林环境，同时并提醒人们在大山猫分布范围内形成各州之间统一的保护管理方案，以保护其历史和现有遗传多样性。 关键词 Lynx rufus 微卫星DNA 线粒体DNA 遗传多样性 基因流 种群结构 北美洲 简介 遗传变异与分化格局是由历史和当代原因共同作用于进化因素形成，包括遗传漂变、基因流和自然选择。包括生存范围扩张和缩小、大范围自然景观变化在内的历史事件起初影响遗传分化格局的形成。然而，现今的基因流情况、人类居所变化等因素也在影响物种的遗传分化格局和种群结构。 对分布广泛、具有长距离迁徙能力、连续区域分布的物种进行遗传分析，可以帮助制定广泛范围内的统一保护措施。而实际情况是动物管理方案大都是由各个州、省划界而分别执行，但移动的物种并不遵循这些人为设定边界，因此此级别的管理方案并不合适，鉴于此，遗传分化研究工作可帮助形成有效管理方案。对广布的、可迁徙物种的研究工作很多，但都集中于多种脊椎，如海洋哺乳动物、陆生哺乳动物、鱼类和爬行动物。此类研究的目的是在清楚物种情况下有效管其遗传变异和制定保护措施。 作为生态链中顶级捕食者，某些猫科动物具有经济重要性和重要的生态学地位。Schwartz等人研究了加拿大猞猁Lynx canadensis的分布范围内的空间分化和种群内动力学，并检测了该物种在其西部生活中心区向外部大数量迁移的基因流。为保持生态链中物种连续性，Schwartz等得出结论，加拿大猞猁种群保护的保护国工作需要际合作。而另一方面，来自芬兰和波罗的海沿岸国家的欧亚猞猁种群的分子水平研究表明，这两个种群存在明显的遗传差异，需要分别管理。此外有研究表明，由于亚马逊河和达瑞恩海峡的阻碍，在美洲豹物种内基因流动受到限制，因此形成可观的遗传分化。 北美山猫是独居、具有高度迁移性、多配偶生活的肉食猫科动物，广泛分布与北美大陆，包括美国大部分地区、加拿和墨西哥部分地区。在北美山猫分布范围内，有12个亚种。亚种分类依据主要是皮毛颜色和颅骨的多变解剖形态。北美山猫可适应多种生境，但都需要森林覆盖，以供迁移及各种活动所需。 北美山猫被认为是被毛游戏性动物，由各州、省分别制定的野生动物保护措施管理。过去几十年内，美国一些州的山猫数量有所增加，并且现在数量上长势头不减。其中39个州内允许捕猎山猫，其他州由于山猫数量相对稀少而禁止猎杀，尤其在中西部地区，由于土地大面积用于耕作而使环境不适于山猫生存。在加拿大北部地区山猫数量有限，北部土著人生活的8个省份中有其个省份允许围猎山猫，而在西部和大西洋沿岸省份山猫则比较常见。由于数量下降，，魁北克省自1991年以来一直禁止猎杀山猫，并且发现山猫数量稳中有升。在墨西哥，有5个省份允许猎杀山猫，但并未发现墨西哥中部和南部山猫的数量减少。 由于较强迁移能力、广泛分布性、国际经济重要性和在北美生态系统中作为顶级捕食者的重要作用，山猫可以作为模式生物，来寻找与遗传多样性、种群分化和保护措施相关的问题。由于山猫并不遵循人为划定的行政州、省边界，因而基于遗传多样性和群体分化而制定的保护措施，比现行的保护政策更为合理。长距离迁徙能力使山猫的基因流动性比较大，分化程度较低。然而，有研究表明由于自然阻隔和人为障碍的存在，基因流只发生在小范围内。了解最大范围内的种群情况，才能发现山猫历史分化和现有种群格局的关联性，以最大程度保存该物种遗传多样性，以供繁盛繁衍和适应环境的所需。 曾有研究评估小范围内的山猫种群遗传结构，而所有种群分布范围内的种群遗传结构、以及其与现有保护政策的相关性，尚无人作相关研究。本文中用用微卫星序列和线粒体DNA来分析历史种群事件和现有种群隔离如何影响北美山猫的遗传多样性和种群分化。本文研究的意义在于为广泛分布物种的保护措施提供参考。 方法 采样与DNA提取 1995年-2006年间采集了587个野生山猫组织样本，包括耳、舌、肝组织。组织样本来源于各州省大学、科研机构以及个人的野生动物研究工作。室温样本保存、加20%的二甲基亚砜溶液中，用氯化钠浸泡直到提取DNA。肝组织样本来源于解剖实验，-70℃冻存。组织样DNA提取试用DNeasy tissue k