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chap2 真核生物基因表达调控.ppt

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选择题 真核生物DNA中大约有百分之2-7的胞嘧啶存在甲基化修饰,绝大多数甲基化发生——二核苷酸对上 A. CC B. CT C. CG D. CA (中科院上海生化所 98) 选择题 非洲爪蟾体细胞中rDNA拷贝数约有500个,而在卵母细胞中的拷贝数约增加了———倍,可以用来转录合成 卵裂所需要的ribosome。 a.1000 b.2000 c.4000 d.400 (中科院上海生化所 2001) 判断题 活跃转录的基因均位于常染色质中,处于异染色质中的基因通常不表达。 ( ) 2. 转录水平的调控 2.1 基因转录的顺式调控元件 2.2 基因转录的反式作用因子 2.3 转录激活因子的作用机制 2.1基因转录的顺式调控元件 顺式调控元件(cis-regulating element)是指对基因表达有调控活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处于一个DNA分子上的基因. 2.1基因转录的顺式调控元件 a. 正调控元件: 启动子(promoter) 增强子(enhancer) b. 负调控元件—沉寂子(silencer) 负调控元件是能抑制基因表达的序列. c. 其它顺式调控元件 :应答元件 转座元件 最常见的应答元件:? 热激应答元件(heatshock response element,HSE) 糖皮质应答元件(glucocorticoid response element,GRE) 金属应答元件(metal response element,MRE) 应答元件(response element) GRE is the recognition site of glucocorticoid receptor. Heat shock response element (HSE) is present in heat shock protein genes. 2.2 基因转录的反式作用因子 转录水平的调控主要是通过与多种DNA元件结合的蛋白因子来实现. 反式作用因子(trans-acting factor)是通过识别和结合顺式调控元件的核心序列而调控靶基因转录效率的一组蛋白质. 反式作用因子对基因表达的调控可正(激活)可负(阻遏). 补充:反式作用及反式作用元件 调控基因不仅能对同一条DNA链上的结构基因起表达调控作用,而且能对不在一条DNA链上的结构基因起作用,在遗传学实验上称为反式作用(trans-action),调控基因就属于反式作用元件(trans-acting element),其编码产生的调控蛋白称为反式调控因子(trans-acting factor)。 2.2.1 反式作用因子的结构区域 DNA结合域(DNA binding domain),多由60-100个氨基酸残基组成的几个亚区组成。 转录激活域(activating domain),常由30-100氨基酸残基组成,这结构域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺、富含脯氨酸等不同种类,一酸性结构域最多见; 连接区,即连接上两个结构域的部分。 a.反式作用因子的DNA结构域 结构域(domain):是指蛋白质中可以具有独立的超二级结构的部分。通常由一个基因外显子编码,并可具有特定的功能。在较大的蛋白质中,多个结构域间可通过较短的多肽柔性区互相联接. 基序(motif):一般指构成任何一种特征序列的基本结构.作为结构域中的亚单元,其功能是体现结构域的多种生物学作用. 1. DNA结合结构域基序 a. Helix-turn-helix(螺旋-转角-螺旋)。是最早发现于原核生物中的一个关键因子,该结构域长约20个aa,主要是两个α-螺旋区和将其隔开的β转角。其中的一个被称为识别螺旋区,因为它常常带有数个直接与DNA序列相识别的氨基酸。 b. Zinc finger(锌指)。长约30个aa,其中4个氨基酸(Cys或2个Cys,两个His)与一个Zinc原子相结合。与Zinc结合后锌指结构较稳定。 含锌指基序的转录因子:与GC盒结合的SPl、类固醇激素受体家族,抑癌蛋白WT1等。 c. Homeodomain(同源域),最早来自控制躯体发育的基因,长约60个氨基酸,其中的DNA结合区与 helix-turn-helix motif相似,人们把该DNA序列称为homeobox。主要与DNA大沟相结合。 d. Basic Leucine Zippers(碱性-亮氨酸拉链) 是亲脂性(amphipathic)的α螺旋,包含有许多集中在螺旋一边的疏水氨基酸,两条多肽链以此形成二聚体。每隔6个残基出现一个亮氨酸。由赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg)组成DNA结合区。 具有亮氨酸拉链基序的转录因子

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