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蛋白复习总结.
1、蛋白质测序策略:
确定蛋白质的纯度在97%以上;
测定多肽链的数目;
拆分多肽链;
分析每一条多肽链的氨基酸组成;
鉴定多肽链的N-末端和C-末端氨基酸残基;
用两种以上方法把多肽链裂解成较小的肽段;
测定各肽段的氨基酸序列;
把各肽段拼接成完整的多肽链;
确定二硫键的位置。
2、蛋白质组学的研究特点: 同一性与多样性、有限与无限、 静态与动态、 时间与空间孤立行为与相互作用、单一手段和多种技术、互补与互助
3、蛋白质组学研究任务
内容:了解某种特定的细胞、组织或器官制造的蛋白质种类、明确各种蛋白质分子是如何让形成类似于电路的网络的、描绘蛋白质的精确三维结构,揭示其结构上的关键部分,如与药物结合并且决定其活性的部位
当前任务:发展高通量、高灵敏度、高准确性的研究技术平台
研究目的:分离蛋白,显示差异,将表现型与功能联系起来;
寻找蛋白质之间的相互作用,动态地反映生物体所处的状态。
4、蛋白质组学研究的两种策略:
“竭泽法:采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多的乃至全部的蛋白质。
“功能法”:研究不同时期细胞内蛋白质组成的变化,如蛋白质在不同环境下的差异表达,以发现有差异的蛋白质种类为主要目标
5、蛋白质化学和蛋白质组学的不同
蛋白质化学 蛋白质组学
单一蛋白质 复杂混合物
全序列分析 部分序列分析
强调结构与功能 强调通过数据库匹配进行蛋白质鉴定
结构生物学 系统生物学
6、氨基酸的分类及结构特点
非极性R基氨基酸 Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Trp、Met共 8 种,这类氨基酸在水中的溶解度较小;
极性R基氨基酸
不带电荷的极性 R 基氨基酸 Ser、Thr、Tyr、Asn、Gln、Cys、Gly
带正电荷的 R 基氨基酸 Lys、Arg、His
带负电荷的 R 基氨基酸 Asp、Glu
7、脂肪族氨基酸:甘氨酸 Glycine 、丙氨酸Alanine 、缬氨酸 Valine、亮氨酸 Leucine
异亮氨酸 Ileucine
亚氨基酸:脯氨酸 Proline 含硫氨基酸 :甲硫氨酸 Methionine、半胱氨酸Cysteine
芳香族氨基酸 :苯丙氨酸Phenylalanine 、酪氨酸 Tyrosine 、色氨酸 Trytophan
碱性氨基酸 :精氨酸 Arginine 、赖氨酸 Lysine 、组氨酸 Histidine
酸性氨基酸 :天冬氨酸 Aspartate 、谷氨酸 Glutamate
含羟基氨基酸 :丝氨酸 Serine
含酰胺氨基酸 :天冬酰胺 Asnaragine 、谷氨酰胺 Glutamine
8、残基:在肽链中氨基酸之间脱去一个水分子,脱水后的残余部分叫残基 (residue),因此蛋白质肽链中的氨基酸统统是残基形式。
9、氨基酸的特性:一般一氨基一羧基的氨基酸等电点在pH 6左右,这是由于羧基的解离程度大于氨基,故pI偏酸,碱性氨基酸pI在pH 10左右,酸性氨基酸的pI在pH 3左右。
氨基酸水溶液中其解离度与溶液的pH有关:向氨基酸溶液中加酸时,羧基接受质子,使氨基酸带正电,加碱时,氨基释放质子,与OH-中和,使氨基酸带负电。
当溶液的pH=pI时,氨基酸以两性离子存在
当溶液的pH<pI时,氨基酸溶液中正离子占优势
当溶液的pH>pI时,氨基酸溶液中负离子占优势。
10、氨基酸的化学性质
与亚硝酸的反应 Van Slyke定氮与甲醛的反应 氨基滴与酰化试剂的反应 氨基保护基与二甲基氨基萘磺酰氯 (DNS-Cl)的反应 测序与2,4-二硝基氟苯 (FDNB) 的反应 测序
与Edman试剂 (PITC 苯异硫氢酸酯) 测序
α-羧基参加的反应:
1. 成盐和成酯反应: 可用于羧基的保护。
2. 成酰氯反应:可用于羧基的活化。
3. 脱羧基反应:是生成胺类的重要反应。
4. 叠氮反应:可用于羧基的活化。
11、蛋白质功能的多样性
催化:大多数酶是蛋白质。
调节:如激素和反式作用因子。
转运:如血红蛋白、血清蛋白、载酯蛋白、膜转运蛋白等。
贮存:如种子蛋白和卵清蛋白。
运动:如肌肉、微管蛋白等。
结构成分:如角蛋白、胶原蛋白等。
支架作用:如锚定蛋白、
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