物信息学预测食品过敏表位.docVIP

生物信息学技术在食物过敏原表位预测中的应用 龙 伟1,3，李 欣1,3，高金燕3,陈红兵1,2* (1. 南昌大学 食品科学与技术国家重点实验室，江西 南昌 330047； 2. 南昌大学中德联合研究院，江西 南昌330047； 3. 南昌大学生命科学与食品工程学院食品系，江西 南昌 330047) 摘要：表位是过敏原与抗体结合的物质基础。基于生物信息学技术的表位预测包括线性表位预测和构象性表位预测。其中线性表位预测主要是基于过敏原蛋白的理化性质进行预测；构象性表位预测主要包括基于蛋白结构信息的预测和结合噬菌体展示技术的预测两大类。生物信息学技术在食物过敏原表位预测中的应用主要包括对牛乳、鸡蛋、鱼和甲壳类水产动物等动物性食物过敏原和花生、大豆、小麦和果蔬类等植物性食物过敏原的表位预测。 关键词：生物信息学；食物过敏原；表位预测 Application of bioinformatics technology in the prediction of food allergen epitopes Long wei1,3，li xin1,3，GAO Jin-yan3，chen hong-bing1,2* (1. State Key Laboratory of Food Science and Technology, Nanchang University, Nanchang 330047, China；2. Sino-German Joint Research Institute, Nanchang University, Nanchang 330047, China；3. Department of Food Science, School of Life Sciences and Food Engineering, Nanchang University, Nanchang 330047, China) Abstract：Epitope is the material basis of reaction of allergens and antibody. The methods of epitope prediction based on bioinformatics included linear epitope prediction and conformational epitope prediction. The linear epitope prediction is on the base of the physico-chemical properties of allergen protein. conformational epitope prediction involves based on protein structure information and combined with phage display technology. Application of bioinformatics technology in the prediction of food allergen epitopes can be mainly applied in the epitope prediction of animal food allergens, such as milk, egg, fish and crustaceans, and plant food allergens, such as peanuts, soybeans, wheat and vegetable. Key words：bioinformatics; food allergy; epitope prediction 中图分类号：TS201.6?????????????? 文献标识码：A????????????? ? 文章编号： 食品过敏属于食品安全范畴，已经成为国内外研究的热点问题之一。据统计，在西方国家中大约有5%的儿童和3-4%成人对食物会发生过敏反应，并可能将继续上升[1]。引起食物过敏的食物种类主要有8种，即牛乳、鸡蛋、鱼、甲壳类水产动物、花生、大豆、坚果以及小麦[2]。开发低过敏或无过敏食物无疑是迫不及待需要解决的问题。 表位又称抗原决定簇，是过敏原与抗体结合的物质基础，也是食物过敏反应的“元凶”[3]。根据结合受体不同分为B细胞表位和T细胞表位；根据其结构不同又可分为线性表位和构象性表位。B细胞表位可以是线性表位也可以是构象性表位，而T细胞表位都是由线性表位构成。表位定位包括实验方法和基于生物信息学的预测方法，前者具有很多优点也包括一