基因组学总结new.docVIP

1.基因组学的定义（lecture1） Genome(基因组)：生物体内所有的DNA的总和。(RNA病毒的基因组是其所有的RNA的总和) Genomics(基因组学)： 本质：在遗传信息的整体水平（基因组）上分析，对生命进行系统研究的科学。 基本研究体系：对单个物种的全部染色体DNA序列测定、序列分析、对序列中的编码区（ORF）预测、功能片段进行注释、功能预测并开展系统研究。 目标： 1）在遗传信息的整体水平上对生命进行分析和研究（基因的结构与功能、基因组的结构、基因之间的相互关系（基因调控、基因间的协调）） 2) 通过整体、系统地比较研究各种不同生物种类的生物的基因组结果与组成，从而探索生命的起源、进化等。 解码生命密码的科学 导致生命科学研究理念、研究方式发生革命性转变 引发生物信息学近年来快速发展 2.与基因组学发展密切相关的学科（lecture1） 遗传学、生物化学、分子生物学、生物信息学。 3、基因组学在生命科学研究中的创新性思想与方法（lecture1） 基因组学与遗传学等传统经典生命科学在研究方法和研究理念方面的区别 方法 出发点 观察范围 效率 低通量学科 分解 假说 局部 低 基因组学 综合 客观实际 整体 高通量 基因组学运用综合方法分析DNA，以客观事实为出发点，对DNA的观察范围处于整体水平上，可以高通量的处理问题。 而传统的生命科学，则是基于将各个阶段分离的方法，提出一些假说去验证，而且也只能观察到基因的局部，因此效率很低。 4、基因组学的主要分支学科（lecture1） i. 功能基因组学 Studies genes’ function at genome level.在基因组层面研究基因功能 ii. 比较基因组学 Compare the sequenced genomes to find the clue of evolution of genome. 通过已测序的基因组间的比较研究基因组的进化 Comparative genomics can be used to help: Gene prediction基因预测 Gene function annotation基因功能注释 Reason and way of gene conservation保守区原因及方法 iii. 结构基因组学 Structural genomics research involves elucidating the structure and organization of genomes. 结构基因组研究包括阐释基因组的结构和组织 Research in this area including:（测序和定位） Mapping基因定位 whole genome sequencing全基因组测序 sequencing of expressed sequence tags (ESTs)表达序列标靶测序 iv. 应用基因组学 Using the genomic information and knowledge for development of agriculture、pharmaceutics、renewable energy. 应用基因组信息可以指导农业、制药、可再生能源的发展 5、鱼类、两栖类、哺乳动物？的模式生物及主要特点与研究应用领域(这部分内容很多，建议多看看ppt) 鱼类：（lecture 11） Atlantic Salmon Genomics 大西洋鲑 Focus: Integrate genetic and physical maps（整合遗传和物理图谱）（Identify genes坚定地基因 ( 16,000)） linked to disease, stress, growth, and development use variation for identifying conservation units 其研究基因与疾病、生长、发育有关，对于测定保守区域有帮助 Characterize gene regions relevant to aquaculture（水产业） Immune system genes Stress and disease Sex determination Flatfish Genomics 比目鱼 Focus: Large-scale genomics and proteomics approaches to enhance the commercial culture of Atlantic Halibut and Senegal Sole. 大范围运用基因组学和蛋白质组学的方法加强atlantic halibut