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重组DNA技术精简版幻灯片
基因重组与基因工程 Gene recombination and genetic engineering 孙庆涛 刘华明 2011.3.16 重组DNA技术又称为基因工程(genetic engineering)或分子克隆(molecular cloning)。 基因工程的操作过程主要由以下步骤组成: ①载体和目的基因的分离 ②载体和目的基因的切断 ③载体和目的基因的重组 ④重组DNA的转化和扩增 ⑤重组DNA的筛选和鉴定 一、载体和目的基因的分离 为了进行基因重组,首先需要对载体DNA和目的基因分别进行分离纯化,得到其纯品。 (一)载体: 基因工程中常用的载体(vector)主要包括 质粒(plasmid) 噬菌体(phage) 病毒(virus) 这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋予一些新的功能,如有利于进行筛选的标志基因、单一的限制酶切点等。 1.质粒: 2.噬菌体: 可通过转染方式将其DNA送入细菌体内进行增殖。常用的为人工构建的λ噬菌体载体。噬菌体两端的片段对于其包装是必需的,因而应予保留;而其中间部分则可进行改造或置换,使之具有某种单一的限制酶切点。目的基因与噬菌体DNA进行重组时,可采用插入重组方式,也可采用置换重组方式。 3.病毒: 常用的为SV40,通过感染方式将其DNA送入哺乳动物细胞中进行增殖。 (二)目的基因: 目的基因的筛选和分离可采用以下方法进行: 1.直接从染色体DNA中分离: 仅适用于原核生物基因的分离,较少采用。 3.从mRNA合成cDNA: 采用一定的方法钓取特定基因的mRNA,再通过逆转录酶催化合成其互补DNA(cDNA),除去RNA链后,再用DNA聚合酶合成其互补DNA链,从而得到双链DNA。这一方法通常可得到可表达的完整基因。 4.从基因文库中筛选: 将某一种基因DNA用适当的限制酶切断后,与载体DNA重组,再全部转化宿主细胞,得到含全部基因组DNA的种群,称为G-文库(genomic DNA library)。 将某种细胞的全部mRNA通过逆转合成cDNA,然后转化宿主细胞,得到含全部表达基因的种群,称为C-文库(cDNA library)。C-文库具有组织细胞特异性。 5.利用PCR合成: 如已知目的基因两端的序列,则可采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,在体外合成目的基因。但此法可能会造成克隆的目的基因碱基序列的改变。 二、载体和目的基因的切断 通常采用限制性核酸内切酶(restriction endonuclease),简称限制酶,分别对载体DNA和目的基因进行切断,以便于重组。 限制酶目前已经发现400多种,所识别的顺序往往为4-8个碱基对,且有回文结构。 由限制酶切断后的末端可形成平端、3-突出粘性末端和5-突出粘性末端三种情况。形成粘性末端(cohesive end)者较有利于载体DNA和目的基因的重组。 三、载体和目的基因的重组 即将带有切口的载体与所获得的目的基因连接起来,得到重新组合后的DNA分子。 (一)粘性末端连接法: 当载体DNA和目的基因均用同一种限制酶进行切断时,二者即可带有相同的粘性末端。如将载体与目的基因混合在一起,二者即可通过粘性末端进行互补粘合,再加入DNA连接酶,即可封闭其缺口,得到重组体。 较少的情况下,对产生的平端也可直接进行连接。 (二)人工接尾法: 即同聚物加尾连接法。当载体和目的基因无法采用同一种限制酶进行切断,无法得到相同得粘性末端时,可采用此方法。 此法首先使用单链核酸酶将粘性末端切平,再在末端核苷酸转移酶的催化下,将脱氧核糖核苷酸添加于载体或目的基因的3-端,如载体上添加一段polyG,则可在目的基因上添加一段polyC,故二者即可通过碱基互补进行粘合,再由DNA连接酶连接。 (三)人工接头连接法: 将人工连接器(即一段含有多种限制酶切点的DNA片段)连接到载体和目的基因上,即有可能使用同一种限制酶对载体和目的基因进行切断,得到可以互补的粘性末端。 五、重组DNA的筛选和鉴定 由于重组体导入宿主细胞的比例通常较低,因此需要对含有重组体的宿主细胞进行筛选并作鉴定。可采用以下方法进行: (一)根据重组体的表型进行筛选: 对于带有抗药基因的质粒重组体,可采用插入灭活法进行筛选。如pBR322中带有抗氨苄青霉素和抗四环素基因,当将目的基因插入抗四环素基因后,就可引起该基因失活,细菌对氨苄青
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