微生物的分类和鉴定.pptVIP

第十章 微生物的分类和鉴定 目前所知道的微生物种数已超过了十万种，这还是一个正在急剧扩大着的数字。微生物分类学(microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它的具体任务有三，即分类(classification)、鉴定(identification)和命名(nomenclature)。 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （一）七级分类单元 种以上的系统分类单元（taxon或category，也称分类阶元或分类群）自上而下依次可分七级，即； 界Kingdom（拉：Regnum） 门Phylum（拉：Phylum）或Division（拉：Divisio） 纲Class（拉：Clsssis） 目Order（拉：Ordo） 科Family（拉：Familia） 属Genus（拉：Genus） 种Species（拉：Species） 第一节 通用分类单元 科级以上分类单元的名称是拉丁或希腊词源的名词、用作名词的形容词或一个拉丁化的外来词，应是阴性、复数并且首字母用大写。实际上，在现代细菌命名中，科以上各分类单元都采用阴性和复数的形容词形式作名词使用，例如Pseudomonadaceae（假单胞菌科）等。 （二）种的概念 在微生物尤其在原核类微生物中，种的定义是极其难定的，至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。可以认为，种是一个基本分类单元，它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（type strain）来作具体标本，故这一典型菌株就是该种的模式种（type species）。 第一节 通用分类单元 在微生物学中，至今种的范围还无法确定。由于在微生物中，尤其在原核生物中的种只是一大群性状极其相同的菌株的总称，所以在微生物学中的“种”至今还只是一个抽象的概念。在这里，具体的种是指能代表这个种的各典型性状的一个被指定的菌株亦即模式菌株。 随着微生物分类学的发展，人们越来越清楚地看到种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上，把DNA同源性的大小作为划分种的标准。 第一节 通用分类单元 在讨论种的问题时，还要介绍一个“新种”（sp.nov.或nov.sp.，是species nova的缩写）的概念。如果某分类工作者在实际工作中获得并鉴定了一个新种，当他按命名规则进行命名并发表时，应在其学名后附上“sp.nov.”符号。例如，由我国学者筛选到的谷氨酸发酵新菌种Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299（北京棒杆菌AS1.299，新种）和C.crenatum sp.nov.AS1.542（钝齿棒杆菌AS1.542，新种），等等。 二、学名 每一种微生物都有一个自己的名字，名字有俗名（common name）和学名（scientific name）两种。俗名指普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众化的优点，但往往涵义不够确切，易于重复，使用范围局限，例如“结核杆菌”(tubercle bacillus)用于表示Mycobacterium tuberculosis（结核分支杆菌），“绿脓杆菌”表示Pseudomonas aeruginosa（铜绿假单胞菌）等等。而学名则指一个菌种的科学名称，它是按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。一个种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组成的。在出版物中应排成斜体字，在书写或打字时，应在学名之下划一横线，以表示它应是斜体字母。根据双名法的规则，学名通常由一个属名加一个种的加词构成。出现在分类学文献中的学名，在此两者之后往往还加上首次定名人（用括号括住）、现名定名人和现名定名年份，但在一般使用时，这几个部分总是省略的。即： 学名=属名＋种的加词＋（首次定名人）＋现名定名人＋定名年份  必要，用斜体排字 可省略，均用正体排字 例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌） Escherichia coli(Migula)Castellani et Chalmers 1919 例2：金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 现将有关学名的若干规定与常识介绍如下： ①属（或亚属）名：是一个表示该种微生物主要特征的名次或用作名次的形容词，单数，其第一个字母应该大写。其词源可来自于拉丁词、希腊词或其他拉丁化的外来词，也可以组合方式形成。 在前后有两个或数个学名排在一起，且在其属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写