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人类FOXL2基因突变谱的系统性研究.doc
人类FOXL2基因突变谱的系统性研究
【摘要】 目的:通过对人类FOXL2基因突变谱研究,确定FOXL2基因突变分型及其与小睑裂综合征的相关性。方法:收集所有的突变,并对这些突变进行统计学处理并分类,进行蛋白表达谱分析,各功能区分析以及患者的临床特征与突变相关性分析。结果:根据分析,将FOXL2基因突变分为10型,各分型与小睑裂综合征患者的临床特征关系各不相同。单纯性卵巢功能早衰患者及单纯性上睑下垂患者与FOXL2基因突变无密切相关性。结论:FOXL2的突变与BPES发病密切相关,多聚丙氨酸区域的丧失与Ⅰ型BPES密切相关。FOXL2的突变与单纯性POF及上睑下垂的发病关系并不密切。
【关键词】 小睑裂综合征; FOXL2; 卵巢功能早衰; 突变
FOXL2基因是一个2.7 kb的单外显子基因,编码376个氨基酸,预期的蛋白质属于翼状螺旋/叉头型转录因子调节家族,包含一个特有的101个氨基酸的forkhead DNA结构域和一个与此分离但功能尚未阐明的多聚丙氨酸肽段。小睑裂综合征(BPES)是表现为睑裂狭小、上睑下垂和倒转型内眦赘皮等一系列症状的常染色体显性遗传病。临床上分为两型:Ⅰ型:女性患者不育,原发闭经或提前绝经、小子宫和卵巢功能早衰;Ⅱ型:男女患者均可生育。目前研究证实FOXL2基因与BPES的发病密切相关,是首选致病基因。
1 材料与方法
1.1 材料 参考The human FOXL2 mutation database(http://medgen.ugent.be/foxl2/)[1],搜集所有报道过的突变,共发现有144个变异位点,其中包括15个单核苷酸多态位点。对这些突变进行统计学处理并分类,同时进行蛋白表达谱分析,各功能区分析,以及患者的临床特征与突变相关性分析。
1.2 突变位点的研究方法 (1)直接测序;(2)多重性连接依赖的探针扩增法;(3)微卫星位点分析和单核苷酸多态性分析;(4)荧光原位杂交技术分析。
1.3 前期实验结果的分析 笔者对一期收集到的29例BPES患者血样进行FOXL2基因突变研究,并将前期实验中所得的突变结果进行分析归类[2-3]。
2 结果
2.1 FOXL2的功能区 FOXL2的功能区包括forkhead DNA结合域(第52~152残基区域)、功能尚未阐明的多聚丙氨酸肽段(221~234位氨基酸残基区)以及转录激活区(第280~320残基区域)。
2.2 分类结果 突变谱共分10型,具体分型如下:A:蛋白截短,无forkhead DNA结合域及其后的所有氨基酸;B:蛋白截短,包含部分forkhead DNA结合域;C:蛋白截短,包含完整forkhead DNA结合域,无多聚丙氨酸肽段及转录激活区;D:蛋白截短,包含完整forkhead DNA结合域和完整的多聚丙氨酸肽段,无转录激活区;E:转录激活区域突变,蛋白截短或延长,包含完整forkhead DNA结合域和完整的多聚丙氨酸肽段;F:转录激活区后的突变,蛋白截短或延长,包含完整forkhead DNA结合域、多聚丙氨酸肽段及转录激活区;G:多聚丙氨酸肽段框架内移码突变,蛋白延长或截短;H:只有错义突变,单个碱基的替换或颠换;I:包括微缺失及FOXL2基因与其他基因的染色体重排;J:其他突变,包括5′-UTR和3′-UTR区域变异。
2.3 患者的临床特征与突变相关性分析结果 所有发现突变的患者均为典型的BPES,两型BPES存在着基因型和表现型的相互关联。同一个突变可导致明显的家系内和家系间的表型多样性,即表现型和基因型的多样性。
A组突变由于forkhead区域的破坏致DNA结合能力的下降,从而导致FOXL2的单型缺陷;由于缺乏相关的信息,对B组不能作出相关性判断;C组,蛋白截短,无多聚丙氨酸肽段及多聚脯氨酸肽段,发生POF几率非常高,多为BPESⅠ型;D组,具有完整的forkhead和聚丙氨酸区域,蛋白截短,家系内存在表现型的多样性;E组,具有完整的forkhead和聚丙氨酸区域,移码突变导致蛋白延长,导致Ⅰ型和Ⅱ型BPES;F组的基因型与表现型亦不能作出相关性判断;G组的多聚丙氨酸肽段突变框架移码突变,导致聚丙氨酸扩增,发生在Ⅱ型BPES家系和类型不明确的家系中。多聚丙氨酸肽段延长,导致聚丙氨酸扩增,多发生在Ⅱ型BPES家系;H组错义突变,由于病例数量少及缺乏相关的信息,不能作出判断;I组发生在散发的患者和家族性BPES,多伴发智力低下;J组未引起任何蛋白变异,由于病例数量少及缺乏相关的信息,不能作出相关性判断。
单纯的卵巢功能早衰(POF)患者中发现的FOXL2的变异均为单核苷酸多态性(SNP),笔者对30例单纯性上睑下垂患者的F
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