遗伝子発现とアライメント.ppt

遺伝子発現 Ｂ４ゼミ発表　酒井大輔 ２００４年　５月１０日 遺伝子発現の全体的な流れ ＤＮＡ　→　ＲＮＡ　→　タンパク質 遺伝子発現に必要な物質（DNA) DNAはクロマチン構造をとっている Ａ，Ｇ，Ｃ，Ｔの４文字で構成されたテープのようなもの 遺伝子発現に必要な物質（ｍＲＮＡ） 遺伝子発現に必要なDNAの遺伝情報はmRNAにコピーされ編集される。 Ａ，Ｇ，Ｃ，Ｕの４文字で構成されたテープのようなもの。 遺伝子発現に必要な物質（tRNA) mRNAの３文字分の情報（コドン）はtRNAによって対応するアミノ酸に対応づけられる。 アミノ酸が結合したtRNAをアミノアシルｔＲＮＡという。 遺伝子発現に必要な物質（RNAポリメラーゼ） ＤＮＡの遺伝情報はRNAポリメラーゼによってRNAに転写される。 原核生物では一種類だが、真核生物では３種類ある。それぞれによって作られるRNAの種類が異なる。 遺伝子発現に必要な物質（リボソーム） ｍＲＮＡ上の情報はリボソームによってタンパク質に変換される。 リボソームはいくつかのタンパク質とRNA(rRNA)によってできている。 原核生物、真核生物ともに大きく２つのユニットに分けられる。 遺伝子コード 翻訳の全体的な流れ リボソームのsmall unitがｍＲＮＡ上のbinding siteを認識し、結合。 リボソームのlarge unitがsmall unitと結合し、翻訳のための複合体を構成する。 ｍＲＮＡの開始コドン（ＡＵＧ）からの情報をタンパク質に移す。 終了コドン（ＵＡＡ，ＵＡＧ，ＵＧＡ）に到達すれば終了する。 原核生物の翻訳（termination) 終了コドンをrelease factor(RF)が認識する Release factor が作成されたタンパク質を切り離す。Formyl化はキャンセルされる。メチオニンも切り離されることがある。 Ribosome recycling factor (RRF)が結合していたリボソームを切り離す 転写の全体的な流れ RNAポリメラーゼがプロモータ領域を認識。 ＤＮＡ鎖をほどきつつ、対応するＲＮＡをつくる。 ヘアピン構造をつくり、終了。 つくられるＲＮＡによっては、プロセシングが行われる。 真核生物の転写制御（DNA-binding protein) NC2: TATA-boxが存在するときはrepressorとして、存在しないときはactivatorとして働く。 Pit-1: 接続する領域によってrepressorとして働くか、activatorとして働くかが変化する。 mRNAのプロセシング Ｃａｐｐｉｎｇ (5’ 末端) Polyadenylation (3’ 末端） Intron splicing 参考文献 GENOMES2 (著者：T.A.BROWN） Instant Notes : Molecular Biology 　（著者：　P.C. Turner, A.G.Mclennan, A.D.Bates , M.R.H.White) * * GGU : gly GGC : gly GGA : gly GGG : gly GAU : asp GAC : asp GAA : glu GAG : glu GCU : ala GCC : ala GCA : ala GCG : ala GUU : val GUC : val GUA : val GUG : val AGU : ser AGC : ser AGA : arg AGG : arg AAU : asn AAC : asn AAA : lys AAG : lys ACU : thr ACC : thr ACA : thr ACG : thr AUU : ile AUC : ile AUA : ile AUG : met CGU : arg CGC : arg CGA : arg CGG : arg CAU : his CAC : his CAA : gln CAG : gln CCU : pro CCC : pro CCA : pro CCG : pro CUU : leu CUC : leu CUA : leu CUG : leu UGU : cys UGC : cys UGA : stop UGG : trp UAU : tyr UAC : tyr UAA : stop UAG : stop UCU : ser UCC : ser UCA : ser UCG : ser UUU : phe UUC : phe UUA : leu UUG