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网络分析结果解读及应用
基因互作及共表达网络
孙之瀚
GCBI应用研究部总监
网络分析结果特点
?点
关键基因/蛋白
?关系
相互作用关系
网络分析应用场景
是否需要定位
差异基因 否 不需要网络分析
关键基因
是 互作关系网络
保守 Signal-Net
网络分析 保守or创新
创新 共表达网络
Rel-Net
基于实验验证数据库KEGG获得
基因互作网络
典型的互作网络结果
互作关系结果解读——点
Gene Symbol Gene Feature Biotype Betweenness Indegree Outdegree Degree
GNAI1 up coding 2490.847 11 8 19
ADCY7 down coding 2303.3333 11 6 17
PRKX down coding 1674.3333 2 12 14
PRKCA up coding 1529 1 11 12
ITGB8 down coding 1467.5 14 3 17
PLA2G4A down coding 1417.7 9 7 16
PIK3R5 down coding 1104.7061 23 6 29
NME1 up coding 1097 9 9 18
PIK3CD down coding 1041.7061 21 6 27
JAK3 down coding 989.2 14 3 17
节点基因 影响基因数量
互作关系结果解读——关系
简写 含义 简写 含义
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