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DNA片段在微流控芯片中迁移的双对数图研究.pdf
DNA片段在微流控芯片中迁移的双对数图研究
傅超然 梁恒2
西安交通大学生命科学与技术学院分离科学研究所,710049
将无胶筛分毛细管电泳的进样、混合、分离集成于仅JL个平方厘米芯片上,就构成了初
2100
步的微全分析系统(u—TAS),当前AgilentBioanalyzer是u—TAS的商品仪器之一,
其DNA片段的迁移规律应该与在毛细管电泳中的相似。DNA片段在筛分电泳中的双对数图,即
出的电泳力学迁移模型(EM姗)推导出来,并用于推算DNA片段相对构象的变化“’21。它也被
用来判断分离过程中溶质大分子迁移机理¨,。
2100
在Agilent
中图A为DNA DNA样品。
Ladders在四种操作模式下的InN对Intr双对数图。图B为其它13
图中Int,一InN曲线均为“S”形与文献¨1结果相似。曲线可分为三部分,中间部分较陡。DNA-1000
的两端较平缓,其中DNA-1000
Ladder(1000bp一17000bp)的斜率为一0.0728(R2=0.9920)接近
ofthe DNA onDNA
relative mobility(·Int.)of size(InN.)onthe
Fig1.Dependence electrophoretlc fragments
of 2100 fourDNA thirteen
Agilent Bioanalyzer.A)Theare ladders,DNA·500、1000、7500and12000.B)The
microchips samples
aleDNA-500PCRMixl、PCRMix2、PCRMix3:DNA—1000
samples
NEBlkb Mass DNALadder.
Sample3;DNA-12000 II、HighLadder、Synthetic
Ladder、Ad21Dral、Ad21Bgl
文献隋1报道的无胶筛分毛细管电泳的相关值斜率平均值-0.079,这说明DNA片段无胶筛分毛细
2100
管电泳币IAgilentBioanalyzer的u-TAS模式中的迁移行为是相似的。
2通讯联系人
当DNA片段以爬行模式迁移时,曲线斜率应为一1.0,而在图1中,曲线最陡部分的斜率
远没有达到一1(即图中黑实线),这说明DNA片段在芯片中的迁移不是以爬行模型H1为主。电
化,说明DNA片段在电泳芯片中迁移时,其相对构象显著地偏离了球形(球形粒子的心=113)
“·引。DNA片段越火,筛分介质浓度越大,DNA迁移时被拉伸而变形的程度越大,其相对构象参
数疋也应该越大。
离范围为300-700bp。从图可见,在四种操作模式下,都没有出现平台区,这说明各操作模式
在对应的DNA范围内所有的DNA片段都得到了较好的分离。
文献
1 粱恒.顾俊岭.王正刚.傅若农,生物医学色谱新进展(西北大学出版社),1994。2.394-395
2. 粱恒.顾俊岭,傅若农。科学通报,1995,40,383.
3.Protozanova 998,75,249·257.
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L.,SalomeL.,Viovy,J.L.,HellerC.,J.Chromatogr.A,1995,710,309·321.
5.De O.,Schwinefus s.C.,MichaelM.D—J
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