DNA片段在微流控芯片中迁移的双对数图研究.pdf

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DNA片段在微流控芯片中迁移的双对数图研究 傅超然 梁恒2 西安交通大学生命科学与技术学院分离科学研究所,710049 将无胶筛分毛细管电泳的进样、混合、分离集成于仅JL个平方厘米芯片上,就构成了初 2100 步的微全分析系统(u—TAS),当前AgilentBioanalyzer是u—TAS的商品仪器之一, 其DNA片段的迁移规律应该与在毛细管电泳中的相似。DNA片段在筛分电泳中的双对数图,即 出的电泳力学迁移模型(EM姗)推导出来,并用于推算DNA片段相对构象的变化“’21。它也被 用来判断分离过程中溶质大分子迁移机理¨,。 2100 在Agilent 中图A为DNA DNA样品。 Ladders在四种操作模式下的InN对Intr双对数图。图B为其它13 图中Int,一InN曲线均为“S”形与文献¨1结果相似。曲线可分为三部分,中间部分较陡。DNA-1000 的两端较平缓,其中DNA-1000 Ladder(1000bp一17000bp)的斜率为一0.0728(R2=0.9920)接近 ofthe DNA onDNA relative mobility(·Int.)of size(InN.)onthe Fig1.Dependence electrophoretlc fragments of 2100 fourDNA thirteen Agilent Bioanalyzer.A)Theare ladders,DNA·500、1000、7500and12000.B)The microchips samples aleDNA-500PCRMixl、PCRMix2、PCRMix3:DNA—1000 samples NEBlkb Mass DNALadder. Sample3;DNA-12000 II、HighLadder、Synthetic Ladder、Ad21Dral、Ad21Bgl 文献隋1报道的无胶筛分毛细管电泳的相关值斜率平均值-0.079,这说明DNA片段无胶筛分毛细 2100 管电泳币IAgilentBioanalyzer的u-TAS模式中的迁移行为是相似的。 2通讯联系人 当DNA片段以爬行模式迁移时,曲线斜率应为一1.0,而在图1中,曲线最陡部分的斜率 远没有达到一1(即图中黑实线),这说明DNA片段在芯片中的迁移不是以爬行模型H1为主。电 化,说明DNA片段在电泳芯片中迁移时,其相对构象显著地偏离了球形(球形粒子的心=113) “·引。DNA片段越火,筛分介质浓度越大,DNA迁移时被拉伸而变形的程度越大,其相对构象参 数疋也应该越大。 离范围为300-700bp。从图可见,在四种操作模式下,都没有出现平台区,这说明各操作模式 在对应的DNA范围内所有的DNA片段都得到了较好的分离。 文献 1 粱恒.顾俊岭.王正刚.傅若农,生物医学色谱新进展(西北大学出版社),1994。2.394-395 2. 粱恒.顾俊岭,傅若农。科学通报,1995,40,383. 3.Protozanova 998,75,249·257. E.,MacgregorJr.R.B.,Biophys.Chem.,l 4. Mimik L.,SalomeL.,Viovy,J.L.,HellerC.,J.Chromatogr.A,1995,710,309·321. 5.De O.,Schwinefus s.C.,MichaelM.D—J Carmejane J.J.,Wang Chromatogr.A,1999,849,267-276. 74

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