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植物叶片DNA的提取 DNA extraction
实验一
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实验原理
利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。一般来说,构建基因组文库, 初始DNA长度必须在100kb以上,否则酶切后两边都带合适末端的有效片段很少。而进行RFLP和PCR分析, DNA长度可短至50kb,在该长度以上,可保证酶切后产生RFLP片段(20kb以下),并可保证包含PCR所扩增的片段(一般2kb以下)。
不同生物(植物、动物、微生物)的基因组DNA的提取方法有所不同; 不同种类或同一种类的不同组织因其细胞结构及所含的成分不同,分离方法也有差异。在提取某种特殊组织的DNA时必须参照文献和经验建立相应的提取方法,以获得可用的DNA大分子,尤其是组织中的多糖和酶类物质对随后的酶切、PCR反应等有较强的抑制作用,因此用富含这类物质的材料提取基因组DNA时,应考虑除去多糖和酚类物质。
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实验材料和试剂
实验材料:植物幼嫩叶子。
实验所需试剂:
提取缓冲液Ⅰ:100 mmol/L Tris·Cl (pH8.0), 20mmol/L
EDTA, 500 mmol/L NaCl, 1.5% SDS
2. 80:4:16/氯仿:戊醇:乙醇
3. RnaseA母液
其它试剂:液氮、异丙醇、TE缓冲液,无水乙醇、70%
乙醇、3mol/L NaAc。
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实验仪器
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离心机
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各种型号的微量移液枪
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研钵
不同型号的eppendorf管
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实验步骤:
水稻幼苗或叶片0.1-0.2g, 剪碎, 置研钵中,加入1mL提取缓冲液,
研磨成浆;
2. 吸入1.5mL EP管中,剧烈摇动混匀;
3. 60℃水浴保温30-60min,不时颠倒混匀;
4. 室温下10000rpm离心5min;
5. 小心吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,剧烈震动;
6. 室温下10000rpm离心5min;
7. 小心将上清吸入新的离心管中;
8. 加入1倍体积异丙醇,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。
8000rpm离心5min ,弃掉上清;
75%酒精洗一次,晾干沉淀;
10. 加入5μL RNaseA(10μg/μL), 37℃ 10min, 除去RNA。
11. 加50-100μl水融解,-20贮存。
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