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分子生物学实验B
实验指导
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实验一?植物总DNA和RNA的提取与鉴定
(一)?植物总DNA的提取
一、目的与要求
1、学习和掌握CTAB法提取植物总DNA的基本原理和实验技术。
2、掌握紫外光吸收法鉴定DNA纯度和浓度的方法。
二、实验原理
CTAB法是一种提取植物总DNA的常用技术。CTAB是十六烷基三甲基溴化铵的缩写,是一种非离子型去污剂。植物叶片经液氮研磨导致细胞壁破裂后,加入去污剂CTAB,可使核糖核蛋白体解析,然后使蛋白和多糖杂质沉淀,DNA进入水相,再用酚、氯仿抽提纯化DNA。CTAB与核酸形成的复合物在高盐(0.7mmol/l NaCl)浓度下可溶;但在低盐浓度(0.1~0.5 mmol/l NaCl)下沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。
核酸、蛋白质、多糖在特定的紫外波长都有特征吸收。核酸及其衍生物的紫外吸收高峰在260nm。纯的DNA样品A260/280约1.8,且1μg/ml的DNA溶液A260约0.020。
三、基本步骤
?1.称取0.2g新鲜的植物叶片,用蒸馏水冲洗叶面,吸水纸轻轻吸干水分;
2.将叶片剪成1cm长,置研钵中,倒入液氮,尽快研磨成粉末;
3.在液氮完成挥发之前,将粉末转入加有750μL预热(65℃)的CTAB提取缓冲液的2mL离心管中,65℃水浴保温30-60 min,不时地轻轻摇动混匀,使其充分裂解;
4.取出,冷却到室温,加入等体积(750μL)的24:1的氯仿/异戊醇,盖上盖子,温和摇动,使成乳状液,静置10min;
5. 10000rpm离心10min;
6.取出离心管(出现3层),小心地吸取上层清液转移到干净的2mL离心管中(根据需要,上清液可用氯仿/异戊醇反复提取多次,去除杂质);
7.沿离心管壁慢慢加入2倍体积预冷的无水乙醇(或2/3体积的异丙醇),(注:为使DNA沉淀完全,可将离心管放于-20℃冰箱中,静置30min以上)。
8.10000rpm离心10min,并室温干燥(或真空干燥)。
9.?用0.2ml 70%乙醇洗涤沉淀?1次,室温下微干,加入70μl?高盐TE缓冲液和1 μl的RNaseA,颠倒混匀,37℃保温0.5h。
10.将沉淀用70%乙醇清洗两次后,晾干,加入50μl TE或无菌水溶解沉淀。
11.加入2倍体积预冷的无水乙?醇,充分混匀,于4℃,7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 r/min)离心15min。
12.测定该溶液在紫外光波260nm和280nm的吸光值计算提取DNA的浓度(也可同时进行琼脂糖电泳)。
五、实验材料与耗材
1、实验材料:植物叶片(幼嫩叶片为佳)。
2、耗材:2ml离心管×1,玻璃棒×1,陶瓷研钵和杵子×1,50ml烧杯×1,剪刀×1,滴管×1。
3、试剂:液氮,CTAB,Tris碱,Na2EDTA,NaCl,β-巯基乙醇,盐酸,氯仿,异戊醇,乙醇
六、仪器与设备
冰箱,恒温水浴锅,高速冷冻离心机,紫外分光光度计
七、注意事项
1、液氮研磨时,小心操作,以免冻伤。
2、所有操作均需温和,避免剧烈震荡。
(二)植物总RNA的提取和含量测定
一、目的与要求
1、了解RNA的特性。
2、掌握Trizol法提取RNA的原理及操作技术。
二、实验原理
RNA分子是化学性质非常活跃的分子。在提取细胞内RNA的过程中,RNA分子容易受细胞内核酸酶、化学试剂、机械震荡等多种因素影响而破坏分子结构,导致提取失败。Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放的核酸酶活性。Trizol适用于从多种组织和细胞中快速分离总的RNA。
三、基本步骤
1、称取1g新鲜的植物叶片,用蒸馏水冲洗叶面,吸水纸吸干水分。
2、将叶片剪成1cm长,置预冷的陶瓷研钵中,倒入液氮,快速研磨成粉末。
3、待液氮蒸发完后,快速称取0.1g粉末移到1.5ml离心管中,加入1ml? Trizol.试剂,充分振荡,冰上静置3~5min。
4、加入200μl氯仿/异戊醇(24:1)或氯仿,剧烈振荡混匀30秒。
5、离心12000rpm,4℃,10min。
6、将上清液小心转移到新1.5ml离心管中,加入与上清等体积的异丙醇,-20℃,30分钟。
???注:不要吸取任何中间层物质,否则会出现DNA?污染。
7、离心12000rpm,4℃,5分钟。
8、小心移去上清液,防止沉淀丢失。
9、加入700μl 70%酒精洗涤,离心12000rpm,4℃,5分钟。
10、重复步骤‘9’。
11、离心结束后,弃去上清,防止丢失RNA沉淀。
12、室温干燥,让乙醇挥发完全。
13、加入30~50μl的DEPC水溶解,可以-70℃保存。
注:可以采用电泳技术或光谱技术检测RNA的浓度、纯度情况。
四、溶液配制
1、Trizol试
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