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protocol With PGM Template OT2 200 Kit only.
Ion one touch
With Ion?PGM??Template?OT2?200?Kit?only.
打开疝气阀门,检查总压力表不低于500psi,少许打开终端阀门,压力表调到30psi,待稳定后关上终端阀门。1psi=7kpa.室温在-25 oC。
打开Ion one touch电源,检查软件版本是否为
Diluate Library, 将E. coli DH10B Control 00 Library 1ul稀释到260ul H2O中。或者将实验样品稀释到。通常Qubit测得N ng/ul的M kb的文库的为N*1.515/M (nM)。
丢掉上次反应用过的。
T”open lid”,安装Recovery route和Recovery tubes。
安装新的Amplification Platedisposable?tubing?到the?pinch?valve。
安装disposable injector,直至上下按动时有响声,并检查是否安装正确。
添加Oil tube至1/2体积,注意Oil用之前的瓶子需要上下颠倒次Ion OneTouch? Sipper Tube。
检查Recovery solution是否有SDS析出,如果有沉淀可以30 oC温浴至清澈上下颠倒次Recovery tube至1/体积。Ion OneTouch? Sipper Tube。
倒掉废液瓶的废液,并重新旋紧废液瓶。Oil waste tray(勿全部拔出),检查是否有oil,如果没有或者少许oil,推回去即可。如果有多余的oil,处理掉之后并联系工程师。
配置扩增反应液。
Ion PGM?Template OT2 00 Reagent Mix第一次使用时,从-20oC取出解冻(解冻之后要储存在4oC)震荡混匀后离心,置于室温。Ion?PGM??Template?OT2?200?PCR?Reagent?B放置到常温,不要放到4oC。打开后半年内摇用掉。打开后震荡1分钟,轻甩后放置到常温。如果发现有沉淀,75 oC温浴1分钟,震荡1分钟,轻甩后放置到常温。
Ion PGM?Template OT2 200 Enzyme Mix弹动混匀后,轻轻离心,放置到冰上。Library震荡5秒钟后离心,放置到冰上。Ion PGM?Template OT2 200 Ion Sphere?Particles放到常温。
依次加入下列成分至1.5mlLoBind??Tube中,保持在常温状态下。
震荡5秒混匀混合液,轻甩2秒后放到常温。
Ion PGM?Template OT2 200 Ion Sphere?Particles(ISP)快速震荡1分钟,轻甩后,吸取100ul到扩增反应液。
震荡5秒混匀混合液,轻甩2秒后放到常温,在15分钟内开始反应。
安装Ion?PGM??OneTouch?Plus?Reaction?Filter?Assembly。
取一个新的Ion OneTouch? Plus Reaction Filter Assembly,倒置到15ml离心管上。其中单独的一个管口为进样口。将准备好的扩增反应液快速垂直震荡5秒钟,快速离心2秒钟或者用手轻甩,避免产生气泡。然后快速用1ml枪头上下吹打样品几次,接着垂直加入到进样口,最后的气泡不必加入。
接着加入1.5ml的Ion OneTouch? Reaction Oil,分两次加,要换枪头,枪头保持垂直并缓慢打入,不要破坏油水界面。
翻转时保持进样口在左侧,顺时针旋转,保持进样口一直保持在油相中。对准Ion OneTouch? Instrument上面的3个孔安装。
运行Ion OneTouch? Instrument,run,Ion?PGM?Template?OT2?200?Kit,按照提示检查每步的任务直至开始运行,运行时间约小时。运行完毕后,样品在Ion OneTouch? Instrument上停留不超过1小时,但是一旦按下next离心,就必须立刻处理。
回收template-positive ISPs。
运行结束后,按下Next,样品离心分钟,丢掉Recovery Router,小心取出2个Recovery Tubes,注意沉淀的方向,用1ml枪头轻轻的吸取上清,留下约50ul,用200ul的枪头吹打混匀后转到一个新的标记的1.5ml离心管,此时不要丢掉枪头和Recovery Tubes。用1ml Ion OneTouch? Wash Solution依次清洗Recovery Tubes后转移到标记的1.5ml离心管中,刚才未丢弃的枪头也需在标记的1.5ml离心管中吹打,彻底洗掉枪头上残留的ISP此产物可以放置3天内使用。
接着15500g,离心
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