CcdB分子生物学研究进展讲义.doc

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学号 2007218018 昆明理工大学硕士研究生 综 述 专 业 微 生 物 学 姓 名 贾 卉 入 学 时 间 2007年9月 日 期 2009年1月8日 CcdB分子生物学研究进展 摘要:毒素-抗毒素系统广泛存在于质粒及大肠杆菌染色体中,在缺乏抗毒素的情况下,毒素通过作用于细胞内不同的酶,使细胞中毒,最终导致细胞死亡。本文综述了ccd系统及自杀基因ccdB的作用原理和机制。 关键词:毒素-抗毒素系统、Ccd系统、CcdB Key words: Toxin-antitoxin system, Ccd system, CcdB 毒素-抗毒素(Toxin-antitoxin,TA)系统是一种可能与细胞生长阻滞或是细胞凋亡有关的系统。该系统最初发现存在于大肠杆菌F质粒上[1],典型的TA系统由两个基因构成。两个基因分别编码一种稳定的毒素蛋白和一种不稳定的抗毒素蛋白,毒素对细菌有致死作用,而抗毒素通过与毒素形成复合体,中和毒素的毒性,使宿主菌能够存活。 TA系统主要存在于一些低拷贝质粒上,细菌分裂后,不稳定的抗毒素蛋白被迅速降解,不具有质粒的子代细菌就会被稳定的毒素蛋白杀死,这种作用称为分裂后致死效应(the post segregation killing effect,PSK),近一步研究发现在大肠杆菌的染色体上也存在TA系统,但染色体上的抗毒素蛋白对毒素蛋白并不能起到解毒的作用,只有依靠质粒上的抗毒素蛋白才能保证细菌存活,低拷贝质粒正是依靠TA系统的PSK效应,稳定在宿主中存在。 目前已知的TA系统包括7个质粒编码TA基因家族:ccd、mazEF、vapBC 、phd/doc、parDE、higBA和relBE[2, 3]。虽然TA系统在基因结构和调控模式上十分相似,但是每种毒素的作用原理却存在很大差异。CcdB和ParE通过使促旋酶失活抑制DNA复制,使细胞中毒。RelE通过切割mRNA,抑制翻译过程导致细胞凋亡。而HigB的作用机理目前尚不清楚。 1. Ccd系统 Ccd(control of cell division or death)为F质粒小F复制子上的一个组件,F质粒共编码三种TA基因系统[4],Ccd系统[5]只是其中的一种,由CcdA和CcdB两个基因共同构成,也可以称为H、G或是letA、letB,分别编码两种小分子量蛋白:CcdA蛋白(8.7kDa)与CcdB蛋白(11.7 kDa)。CcdA蛋白易被Lon蛋白酶降解,在系统中起到解毒剂的作用,CcdB蛋白较CcdA蛋白稳定,是一种细胞毒素,在没有解毒剂存在的条件下,可以导致细胞凋亡。 2. CcdB CcdB编码一个101个氨基酸的蛋白(图1),能使DNA促旋酶复合体中毒,并抑制促旋酶的活性。 图1 CcdB蛋白二聚体的二级结构拓扑图[6] 红色的为5条反向平行的β—折叠,稍短的3条紫色的为翼型折叠,黄色为C端的α螺旋。 但是,当存在CcdA蛋白时,CcdB蛋白活性因为形成CcdA-CcdB紧密复合体而受到一定程度的抑制。 3. CcdB蛋白作用原理 3.1 促旋酶 促旋酶是一种在原核生物有机体中必须存在且高度保守的酶,属于拓扑异构酶II,大肠杆菌促旋酶作为一种罕有的拓扑异构酶,在ATP存在时,能够解除负超螺旋。大肠杆菌促旋酶为四聚体,由两个GyrA亚基(97kDa)和两个GyrB亚基(90kDa)组成。GyrA亚基有两个功能不同的结构域[7],其中N-端结构域(59kDa)与DNA 断裂-修复有关,而C-端结构域(37kDa)为DNA结合结构域,与DNA折叠有关,整个GyrA亚基形成酶的催化中心,与DNA断裂—再接合反应有关。GyrB亚基同样由两个结构域组成,N-端结构域(43kDa)决定着促旋酶的活性,其作用是结合和水解ATP,C-端结构域(47kDa)的功能目前还不清楚[8]。 3.2 CcdB蛋白与促旋酶的相互作用 促旋酶通过GyrA亚基上的Tyr122共价结合DNA,并诱发DNA的断裂,断裂的DNA称为G-segment ,同时,另一条称为T-segment的完整DNA穿过G-segment的断裂处,释放到DNA-促旋酶复合体以外,G-segment在原断裂处重新被修复。正是通过这样的断裂—再接合反应,促旋酶不断地向DNA结构中引入负超螺旋,使基因的转录和复制能够顺利进行。体外实验证明:CcdB蛋白存在时,促旋酶GyrA亚基和CcdB蛋白直接结合,形成复合体(α复合体),CcdB蛋白对促旋酶水解ATP和促发超螺旋的能力没有影响,即对促旋酶没有毒性

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