CASTEP模块计算表面上的吸附能讲稿.pptVIP

注意，不能用中文建目录。 计算结果要及时保存。 CO吸附在Pd（110）面 目的：介绍用CASTEP如何计属表面上的吸附能。 模块：CASTEP，Materials Visualizer 背景知识：Pd的表面在许多催化反应中都起着非常重要的作用。理解催化反应首先是弄清楚分子是如何与这样的表面相结合的。在本篇文章中，通过提出下列问题，DFT（密度泛函）模拟有助于我们的理解：分子趋向于吸附在哪里？可以有多少分子吸附在表面？吸附能是什么？它们的结构像什么？吸附的机制是什么？ 我们应当把注意力集中于吸附点，既短桥点，因为众所周知它是首选的能量活泼点。而且覆盖面也是确定的(1 ML)。在1 ML 覆盖面上CO 分子互相排斥以阻止CO 分子垂直地连接在表面上。考虑到(1x1)和(2x1)表面的单胞，我们将要计算出这种倾斜对化学吸收能的能量贡献。 绪论:在本指南中，我们将使用CASTEP来最优化和计算数种系统的总体能量。一旦我们确定了这些能量，我们就可以计算CO在Pd(110)面上的化学吸附能。 本课程包括： 1. 准备项目 2．最优化Pd 3. 构造和优化CO 4．构造Pd(110) 面 5. Relaxing Pd(110)面 6. 添加CO到1x1Pd(110)，优化此结构 7. 设置和优化2x1Pd(110)面 8. 分析能量 9. 分析态密度 1．准备项目 选一路径，建立一个CO-Pd文件夹。然后按下列操作， 在CO-Pd文件夹中生成CO-Pd的Project。 本指南包含有五种明显不同的计算。为便于管理项目，我们先在项目中准备五个子文件夹。在Project Explorer的根图标上右键单击，选择New | Folder。再重复此操作四次。在New Folder上右键单击，选择Rename，键入Pd bulk。在其它的文件上重复此操作过程，把它们依次更名为Pd(110)，CO molecule，, (1x1) CO on Pd(110)，和 (2x1) CO on Pd(110). 2．最优化bulk Pd Materials Studio所提供的结构库中包含有Pd的晶体结构。 在Project Explorer中，右键单击Pd bulk文件夹并且选择Import....，从Structures/metals/pure-metals中导入Pd.msi。 显示出bulk Pd的结构，我们把显示方式改为Ball and Stick。在Pd 3D Model document中右键单击，选择Display Style，在Atoms标签中选择Ball and Stick，关闭对话框。 现在使用CASTEP来优化bulk Pd。 从工具栏中选择CASTEP ，再选择Calculation或菜单栏中选择Modules | CASTEP | Calculation。 CASTEP对话框如下： 把Task从Energy改为Geometry Optimization，按下More...按钮，在 CASTEP Geometry Optimization对话框中选中Optimize Cell选项。按下Run键。出现一个关于转换为原胞的信息框，按下OK。 工作递交后，开始运行。结束后出现如下信息。 工作完成后，我们保存项目，选择File | Save Project。然后在Project Explorer中打开位于Pd CASTEP GeomOpt文件夹中的Pd.xsd，显示的即为Pd优化后的原胞结构。由下面步骤恢复Pd优化后的晶胞结构。 注意保存计算结果 在左侧的Properties中选择Lattice 3D，从中可以看到优化后的晶格参数大约为3.95 ?，其而其实验值为3.89 ?。 现在我们应该进行下一步操作，构造CO分子。 3．构造和优化CO CASTEP只能处理周期性的体系。为了能够优化CO分子的几何结构，我们必需把它放入晶格点阵中。 在Project Explorer中，右键单击文件夹 CO molecule，选择New | 3D Atomistic Document。在3D Atomistic Document.xsd上右键单击，选中Rename。键入CO，按下RETURN键，建立CO.xsd文件。 现在显示的是一个空3D模型文档。我们可以使用Build Crystal