第五章 生 命 中 的 金 属 本章内容 5.1 生命中的金属元素及其研究简史 与生命相关的元素 1. 生命中化学元素的分类 宏量元素 H、C、N、O、P、S 矿物质元素 Na、K、Mg、Ca、Cl 微量元素 Fe、Zn、Cu 超微量元素 非金属元素F、I、Se、Si 金属元素Mn、Mo、Co、Cr、Li 地壳中金属的丰度 E. coli 中的金属元素 K、Mg >10 mM Fe、Zn ≈0.1 mM Cu、 Mn、Mo ≈ 10 μM Co、Ni 最低 有利于活性中心与底物结合 生命中的金属元素 活性中心动力学上活泼 热力学上稳定 生物无机化学 利用生物学或化学的方法研究无机物质(尤其是金属离子及其复合体)的存在形式、分布、代谢及生理作用的学科。 肌红蛋白:肌肉中运载氧的蛋白质 血红蛋白:负责运载氧 2. 金属离子的功能 DNA聚合酶 RNA聚合酶 蛋白质合成 金属活性中心功能 胞内金属离子浓度过高 5.2 生物无机化学 5.2.1 金属离子的运输、储存和浓度平衡控制 1. 金属离子的生物利用度和输运过程 生物利用度:获得元素的难易程度。 e.g. 水溶液中获得Fe离子。 合成金属蛋白 金属离子跨膜进入细胞 物质跨膜运输 方式:被动运输、主动运输、胞吞胞吐作用 机制: 离子载体、离子通道、离子泵 一、被动运输 被动运输 由膜的高浓度一侧向低浓度一侧移动的过程。 主要因素 ①膜两侧的溶质分子浓度梯度。 浓度梯度大,物质顺浓度梯度扩散就多。 ②膜对该物质的通透性。 物质依靠膜上“泵蛋白”的作用,由膜的低浓度一侧向高浓度一侧转运的过程。 一些大分子或物质团块的转运,是通过入胞作用和出胞作用来实现的。 2. 金属离子的储存和浓度平衡控制 浓度过大 中毒反应 平衡控制 离子储存 特异性识别 细胞如何指导金属离子过剩还是缺乏??? 机理复杂 目前认为金属识别蛋白可以控制金属转运基因的表达。 5.2.2 金属蛋白和金属酶 酶的分类: 氧化还原酶 转移酶:催化基团转移交换。 水解酶:催化底物水解。 裂解酶:一个底物分解为2个化合物或2者合成一个化合物 异构酶:催化异构体间的转化。 合成酶: 2个底物分子合成一个化合物。 氧化还原过程 电子传递 呼吸过程 合成代谢和分解代谢反应 1)铁硫簇化合物 2)细胞色素:血红素基团的铁原子传递电子 3)铜蛋白 钼铁蛋白 1)铁硫簇化合物 铁氧还蛋白 非酶蛋白质,含有数目相同的铁原子和活泼的硫原子,广泛存在于微生物、叶绿体和线粒体中,在多种氧化还原系统中作为电子载体。 铁硫簇合物基本结构 功能 氧化还原 电子传递 存储铁原子、提供硫原子 与mRNA结合,调控基因表达和酶活 2)细胞色素C 含血红素的电子传递蛋白。 在氧化还原过程中,血红素基团的铁原子可以传递单个的电子,通过Fe3+和Fe2+两种状态的变化传递电子。 细胞色素C 3)钼铁蛋白 固氮酶 一种能够将分子氮还原成氨的酶。 氮循环 2.非氧化还原过程 水解酶 普遍含锌和铁 尿素酶:人和动物胃肠道及泌尿道细菌感染中常见的酶(如HP),含有Ni离子的金属酶。 铁铜 3. 催化原子、分子及基团的转移 血红蛋白 运输氧的蛋白 蚯蚓血红蛋白 血蓝蛋白 黄嘌呤氧化酶:含钼,在氧迁移过程中起作用。 辅酶B12:含钴,C-Co键。 5.2.3 金属与核酸 碱基 戊糖 磷酸 1)金属与磷酸基的作用(生物体系中最重要的作用) 正价的金属离子 负价的磷酸基上的氧原子 盐桥复合物 2)金属与戊糖的作用(配位能力最弱) -OH上的O2’ 和O3’原子与主族金属离子结合。 3)金属与碱基的作用(配位能力最强) 碱基上所有原子都能与金属配位 双螺旋结构的大沟、小沟都
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