杜仲幼果和叶片MVA途径基因表达差异分析.pdfVIP

第 44 卷第 5 期 2016 年 5 月 西北农林科技大学学报(自然科学版) Journal of Northwest A.F University(Nat. Sci. Ed.) 网络出版时间: 2016-04-07 09 :00 DOI: 10. 13207/j. cnki. jnwafu. 2016. 05. 013 网络出版地址: /kcms/ detail/6 1. 1390. S. 0900. 026. html Vol. 44 No.5 May 2016 杜仲幼果和叶片 MVA 途径基因表达差异分析 王 淋1 ， 2 ，乌云塔娜1 ， 2 ，叶生晶 3 (1中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州 450003;2 国家林业局杜仲工程技术研究中心， 河南郑州 450003;3 国家林业局中南林业调查规划设计院，湖南长沙 410014 ) [摘 要] [目的】杜仲橡胶是一种多商类物质，而甲短戊酸(MVA)途径是合成蔽类物质的重要途径之一。分 析杜仲 MVA 途径相关基因表达的差异，预测杜仲橡胶合成的主要上游途径。 E方法】在杜仲幼果和叶片转录组测序 的基础上，根据基因功能注释和表达分析，确定 MVA 途径的系列基因，并对其进行表达差异分析。 E结果】杜仲橡胶 合成的 MVA途径共涉及 23 条 Unigene.分别为 3 条 EuACOT、 3 条 EuHMGS、8 条 EuHMGR 、 2 条 EuMK 、 l 条 Eu- PMK 和 6 条 EuMDP 基因。根据转录组 RPKM(Reads Per Kilo bases per Million reads)数据对基因表达差异进行分 析，结果表明杜仲 MVA 途径中的 EuACOT8 、 EuACOTlO 、 EuHMGS4 ， EuHMGS5 , EuHMGS6 、 EuHMGR18 、 Eu- MK3 、EuMK4 ，EuMDP7 、EuMDP8 、EuMDP9 、EuMDP10 、EuMDPll 基因在幼果和叶片中的表达量具有显著差异， 其中仅 EuMDP9 在叶片中的表达量大于幼果，而其余基因在幼果的表达量大于叶片;EuHMGR15 和 EuHMGR17 只 在幼果中特异表达。 E结论】 MVA 途径绝大部分基因在果实中大量表达，这与果实中杜仲橡胶含量远超过叶片的现 象相吻合，推测杜仲果实 MVA 途径为杜仲橡胶合成的主要途径。 [关键词] 杜仲;幼果和叶片;甲经酸途径;基因表达差异 [申团分类号] Q786 [文献标志码] A [文章编号] 1671-9387(2016)05-0097-08 Differential expression of MVA pathway genes in young fruits and leaves of Eucommia ulmoides Oliver W ANG Lin 1. 2 ,WUYUN Ta-na 1 ? 2 ,YE Sheng才 ing3 (1 Non-timber Research and Develo户nent Center of CAF .Zhengzhou.Henan 450003.China; 2 The Eucommia Engineering Research Center of State Forestry Administration ? Zhengzhou. H enan 450003. China; 3 Central South Forest Inventory and Planning Institute of State Forestry Administration .Changsha.Hunan 410014.China) Abstract: [Objective Eucommia ulmoides Rubber (EuR) is one type of terpenoids ,which can be syn- thesized by mevalonate (MVA) pathway. This study analyzed the differential expression of genes in MVA pathway in young fruits and leaves of E. ulmoides oliver and predicted main pathways of EuR synthesis. [Method According to the high-throughput transcriptome sequencing (RAN-seq) data ,functional annota-