第七章分子标记辅助选择讲述.ppt

只含一个供体基因，淘汰 连锁累赘，淘汰 黑色示供体亲本片段 白色示轮回亲本片段 灰色示单交换区 箭头示目标基因区 含两个目标基因，连锁累赘少，保留作下轮回交用 三个植株的图示基因型 二、数量性状的标记辅助选择 质量性状的标记辅助选择方法也适用于数量性状。 影响数量性状标记辅助选择的因素很多，其难度要比质量性状大得多。 1)还没有哪个数量性状的全部QTL被精确地定位出来。 2)在育种过程中同时对许多目标基因(QTL)进行选择是一个比较复杂的问题。 3)上位性效应会影响选择的效果，使选育结果不符合预期的目标。 4)不同数量性状间可能存在遗传相关。 数量性状选择的方法 1、表型值选择 传统的选择方法。 在基因型值中，只有加性效应成分才可以真实地从上代遗传给下代，基因的加性效应值越高，依据表型值选择效率越高。加性效应值可以狭义遗传力近似表示。 以个体标记值为依据的选择称为标记值选择。 利用完整的分子标记连锁图进行QTL定位分析，原则上能够估计出个体的加性效应值。但要得到个体加性效应值的精确估值，必须进行QTL的精细定位。 在加性模型下，性状—标记回归方程为： y为个体的表型值，μ为模型均值；ɑi为第i标记的加性效应值；χi为第i标记基因型指示变量，对应于基因型MM、Mm和mm分别取1、0和-1；ε为环境误差；N为标记数。 2、标记值选择 应用逐步回归分析可以筛选出对目标性状效应明显的标记，然后将它们的加性效应估值算出个体的标记值 个体的标记值为： 标记值m是个体加性效应值的近似值，其近似程度取决于 P=δ2M/δ2G 3、指数选择 用表型值和标记值构建一个选择指数，依选择指数进行选择。 Ζ为表型值，m为标记值，bz和bm为权重系数(bz十bm＝1) 选择指数也是对加性效应值的一种近似值，其近似程度取决于它的遗传力 1)h2I越大，则选择指数越接近加性效应，选择的效率高。2)当p＝0时，有h2I＝h2，这时相当于单纯的表型值选择。 3)当h2值一定时，h2I随p的增大而增大，且h2越低，h2I随p的增长速度越快，这说明，性状的遗传力越低，则标记值的影响越大，因而标记辅助选择的作用也就越大。 不论是标记值选择还是指数选择，都只在选择早期有优越性，在高世代则宜用表型值选择来获得进一步的遗传进度。 4、基因型选择 标记值选择和指数选择都只是(通过基因型的加性效应值)对基因型的间接选择，与表型值选择没有本质的区别。 不同的基因型可能产生相同的基因型值，依基因型值的选择存在着遗传信息的简并或丢失，尤其是效应较小的QTL有利等位基因的丢失。 直接依据个体的基因型进行选择，即对每个目标QTL利用其两侧相邻标记或单个紧密连锁的标记进行选择，这是才真正的标记辅助选择。 数量性状QTL标记辅助选择的困难：初级定位，效应小的QTL未被检测。 用3个相邻的连锁标记进行跟踪选择(保证QTL位于目标区段内) 灰色长方条和其右侧数字分别表示QTL位置的置信区间范围和宽度(cM)，侧面的箭头表示所指方向还连有染色体的其他部分，中间竖杠示目标QTL的估计位置，黑色倒三角形示标记的最佳位置。 QTL位于染色体中部 QTL位于染色体末端 三、标记辅助选择的应用研究 1、单个主基因的回交转移 明恢63×IRBB21(Xa21) F1 × 明恢63 多代回交 SCAR标记检测 46个纯合抗性系 T71 T81 新恢复系 组合 协优T71 协优T81 对照 明恢63 汕优63 广谱高抗白叶枯病主基因 平均病斑长度 2cm 3.72cm,4.35cm 10.48cm 23.84cm 2、QTL的回交转移 美国玉米杂种优势遗传改良 用76个标记定位有关QTL ①在第一套杂交中定位的QTL，除了一个之外，其余都表现出超显性性，对B73×Mol7的杂种优势有明显的贡献，说明超显性是产生杂种优势的主要原因。 ②尽管环境差异很大（6个不同环境中），环境效应很明显，但却没有发现明显的基因型(QTL)与环境的互作。 ③在第二套杂交中发现，Tx303和Oh43各在6个QTL上具有有利等位基因，分别转入B73和Mol7后，均可提高B73×Mo17的杂种优势 在玉米自交系Tx303和Oh43中检测到的染色体区段(QTL)位置，这些区段分别转入自交系B73和Mol7后，预计可以提高B73x M017的产量杂种优势。 141株系 增产45个(32%) 减产15个(11%) 116株系 增产51个(44%) 减产10个(9%) 组合 产量／(蒲式尔／英亩) 1993 1994 平均 改良系组合 B73(248-6)/Mo17(284-7) 178.7 170.9 174.8 B73(257-1)/Mo17(271-8) 178.1 169.5 173.8 B73(198-2