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凡纳滨对虾引进群体与养殖群体遗传多样性的AFLP分析
文章编号: 1000-0615(2017)03-0339-08 DOI: 10.11964/jfc.20140709398
凡纳滨对虾引进群体与养殖群体遗传多样性的AFLP分析
叶 宁, 包秀凤, 刘建勇*
(广东海洋大学水产学院,湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室,广东 湛江 524088)
摘要:为了解引进群体与国内养殖凡纳滨对虾群体遗传多样性水平,提高我国凡纳滨对
虾种质改良效果,应用AFLP标记技术对国外引进群体和国内养殖凡纳滨对虾群体的遗
传多样性进行分析。采用7对AFLP引物组合对7个群体 (4个引进群体,3个养殖群体 )
210个个体进行扩增,结果发现,7个群体在100~500 bp共检测到105个位点,其中多态性
位点为90个,多态位点比例为85.71%。4个引进群体(KONABA、SISMAN、OI、CHAI)的
多态性位点百分率分别为62.5%,57.29%,61.21%,61.46%;3个国内养殖群体(ZX、
ZK、GDOU)的多态性位点百分率分别为65.63%,61.46%,54.17%。7个群体的平均期望
杂合度为0.202,表明所检测的7个群体均具有较高的遗传多样性。AMOVA分析显示,
51.79%的变异来源于群体间,群体的平均ΦST值为0.518,表明凡纳滨对虾群体内遗传多
样性非常丰富,群体间相似性较大,且存在较强的基因交流。本研究可为我国凡纳滨对
虾种质改良提供基础资料。
关键词: 凡纳滨对虾;遗传多样性;遗传差异;扩增片段长度多态性
中图分类号: Q 347;S 917.4 文献标志码: A
凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)具有肉质
鲜美、对水环境因子的变化适应能力强及便于
运输等优点,是在中国占绝对优势的养殖对虾
品种[1]。但由于科学良种选育和保种技术体系缺乏、
病害检验检疫的松懈和累代养殖等导致我国多
代养殖的凡纳滨对虾种质退化严重,表现为生
长缓慢、病害高发及规格参差不齐等现象,这
对我国对虾养殖业的经济效益及可持续发展造
成了严重的影响 [1-2]。引进原种或改良现有养殖
品种是恢复和优化凡纳滨对虾种质的有效途径,
在品种选育过程中,必须在掌握群体遗传背景
的基础上,才能充分利用杂种优势加快育种进
程,所以在制定选育计划的同时,应及时评估
已有群体的遗传资源现状[3]。
扩增片段长度多态性 (amplified fragment
length polymorphism, AFLP)技术是1992年荷兰科
学家Vos等 [4]发明的以DNA双酶切位点为多样性
分析基础的分子生物学技术。AFLP具有信息量
大、灵敏度高和多态性丰富及无需了解基因组
序列信息等优点,可以利用少量引物检测到大
量的有效位点进行分析[5]。目前,利用AFLP标记
技术,已初步构建了中国明对虾(Fenneropenaeus
chinensis)[6]、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)[7]
和太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)[8]等的遗传连锁
图谱,颉晓勇等 [9]、薛姝雯等 [10]和王豪杰等 [11]
分别对凡纳滨对虾6个不同群体、不同家系和4个
不同世代群体的遗传多样性进行了评估,均验
证了AFLP标记技术是一种研究群体间遗传多样
性非常有效的工具。本实验运用AFLP标记技术
分析和探讨了凡纳滨对虾引进群体与国内养殖
群体的遗传多样性及遗传差异,从分子水平上
比较了引进群体与国内养殖群体的遗传变异
情况,为下一步凡纳滨对虾种质改良提供基础
数据。
第41 卷 第 3 期 水 产 学 报 Vol. 41, No. 3
2017 年 3 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Mar., 2017
收稿日期:2014-08-05 修回日期:2015-11-26
资助项目:广东省科技计划(2010B020201014);广东省海洋与渔业局海洋渔业推广专项(A200899E04,A201001H05,A201101B05)
通信作者:刘建勇,E-mail:liujy70@126.com
1 材料与方法
1.1 实验材料
实验材料来源于湛江市海威水产养殖有限
公司,收集于2013年6—8月,包括4个凡纳滨对
虾引进群体[科纳湾群体(KONABA)、迈阿密群
体(SISMAM)、夏威夷群体(OI)、泰国正大群体
(CHAI)]和国内3个养殖群体 [中科一号(ZHONGKE
No. 1,简称ZK)、中兴一号(ZHONGXING No.1,
简称ZX)、广东海洋大学遗传育种中心(GDOU)],
从7个群体中各随机选取30尾,共210尾,取虾尾
肌肉于无水
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