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- 2017-04-07 发布于湖北
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客户关注的信号通路(pathway) 差异表达蛋白相互作用网络分析 利用MetaCore软件,对所有显著差异表达蛋白进行相互作用网络分析,。相互作用网络分析显示,差异表达蛋白富集到30条经典子网络,右为包含“SP1, TRAP230, Neprilysin, MIF, SLC38A2”等关键节点的子网。 总结 总结:iTRAQ技术及后期分析可以帮助客户很好地验证试验猜想,以及为揭示蛋白表达变化原因提供可靠的方向指引。 高阶(客制化)信息分析 详见信息分析PDF iTRAQ详细实验步骤—ABI试剂盒 iTRAQ详细实验步骤 1:蛋白质提取 可以选择提取蛋白质常用的各种溶液,裂解液里最好不要包括下面试剂,因为这些试剂会干扰iTRAQ试剂的标记反应。 iTRAQ详细实验步骤 2:蛋白质定量 (1) 可以采用Bradford方法及其他方法定量初步 (2) 定量取各组样本的蛋白质进行SDS-APGE电泳,银染定量,根据每个涌道染色情况微调蛋白浓度,保证后续实验中每组样本的蛋白量相同。 iTRAQ详细实验步骤 3:酶切,标记 每组样本(各100μg)分别加入-20℃预冷的丙酮(丙酮:样品体积比=6:1),颠倒混匀,-20℃沉淀30min~4h(根据样品所需沉淀量选择时间,一般开始时可选1小时); 12000rpm 离心15分钟,弃上清,用试剂盒中自带的溶解液disso
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