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古细菌Pyrococcus horikoshii糖酵解途径酶类的生物信息学统计 作 者 姓 名 沙 岩 专 业 生 物 技 术 指导教师姓名 刘 波 专业技术职务 （目录格式） 目 录 （三号、黑体、居中、目录两字空四格、与正文空一行） 摘 要 ……………………………………………………………1 第一章（空两格）☆☆☆☆☆（小三号、黑体字）………2 1.1☆☆☆（四号黑体） ………………………………………………2 1.1.1☆☆☆（四号黑体）………………………………………………4 1.1.2☆☆☆ ……………………………………………………………7 1.2☆☆☆ ………………………………………………………………9 1.2.1☆☆☆……………………………………………………………15 1.2.2☆☆☆……………………………………………………………24 第二章（空两格）☆☆☆☆☆…………………………… 29 2.1☆☆☆………………………………………………………………29 2.2☆☆☆………………………………………………………………35 …… …… …… 山东轻工业学院2009届本科生毕业论文 PAGE 1 PAGE 21 摘 要 葡萄糖通过“中心代谢途径”降解为丙酮酸的过程对于生物体物质及能量的代谢具有重要的作用。古细菌的葡萄糖酵解过程具有与真核生物以及细菌葡萄糖代谢显著不同的特征。 随着基因组学和蛋白质组学的发展,生物信息学在数据处理中的应用已经越来越广泛。作为数据处理中越来越重要的分析手段,蛋白质组学数据库是蛋白质组学的主要内容之一。生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。序列比对是生物信息学中的一个基本问题, 设计快速而有效的序列比对算法是生物信息学研究的一个重要内容, 通过序列比较可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息, 序列比较的基本操作是比对。本文介绍了序列比对算法的发展现状, 描述了常用的各类序列比对算法, 并分析了它们的优劣。 本实验通过生物信息学分析，运用GenBank、ClustalX、ClustalW、Swiss-Model、BLAST等数据库和工具，得到与古细菌糖酵解途径酶类的 关键词：生物信息学 ABSTRACT Glucose is degraded to pyruvate via the so called “central metabolic pathways” that play vital roles in the carbohydrate and energy metabolism of organisms. Some variances to the classical glycolytic pathways in bacteria and eukarya are presented in the glycolysis of archaea. Bioinformatics plays an important role in genomics and proteomics to analyze the vast data from experiments. Recently , many labsestablished a lot of proteomic databases. Bioinformatics is the subject of using computer to store, retrieve and analyze biological information. Sequence alignment is a basic problem in Bioinformatics, and its main research work is to develop rapid and effective sequence alignment algorithms. We may discover functional, structural and evolutionary information in biological sequences by sequence comparing. This paper introduces the development actuality of sequence alignment algorithms, describes variety of sequence alignment algorithm and analyses