蛋白质组学数据分析;1.蛋白质组学质谱分析背景介绍
2.蛋白质组学数据库检索软件GPM(X!tandom)
3.蛋白质组学数据统计分析软件TPP
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GPM(X!tandem); GPM(X!tandem) SEQUEST Mascot
类型 免费开源软件 商业软件 商业软件
数据输入 DTA,PKL,MGF RAW,DTA MGF,DTA
mzXML,mzDATA
速度 快 较慢 较慢
并行运算 支持(PVM,MPI) 支持(PVM) 支持(MPI)
;X!Tandem
优点:
运算速度快
免费,并行集群计算成本低
开源可自行修改代码
缺点:
应用范围尚不广泛
后期统计软件接口尚未成熟
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