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生物芯片扫描分析系统DSP软件设计.pdf

第 11 卷第 2 期 2004 年 4 月 工 程 设 计 学 报 Journal of Engineering Design Vol. 11 No. 2 Apr. 2004 收稿日期 : 2003-11-15. 基金项目 : 国家自然科学基金仪器专项资助项目 ( . 作者简介 : 虞晓琼 ( 1 7 ) 9 女 9 浙江湖州人 9 硕士 9 从事 DSP 软件 ~ 视频编解码研究 9 E - mail : yu X g 163. com . 生物芯片扫描分析系统 DSP 软件设计 虞晓琼 9 张 桦 ( 浙江大学 数字技术及仪器研究所 9 浙江 杭州 310027) 摘 要 : 生物芯片扫描分析系统是生物芯片能否得到广泛应用的关键仪器 . 针对传统生物芯片扫描分析系统结构 复杂 ~ 处理速度慢 ~ 体积庞大等弱点 9 引入 DSP 处理器完成扫描控制和全自动数据分析处理 . DSP / BIOS 的运用使 得系统 DSP 软件设计简单化 . 概述了整个系统的结构 9 详细介绍了生物芯片扫描分析系统 DSP 软件结构和设计 9 包括 DSP / BIOS 的运用模块 ~ BOOT 的过程 ~ 扫描控制模块 ~ 数据处理模块和 ~PI 模块 . 目前该系统已进入了稳定 工作的状态 . 关键词 : DSP 处理器 ; DSP / BIOS ; DSP 软件设计 ; 生物芯片扫描分析系统 中图分类号 : TP 31; TP 36 文献标识码 : A 文章编号 : 1006-754 X ( 2004) 02-008 -04 Sof tware design of biochip scanning and analyzing system YU Xiao giong 9 Z~ANG ~ua ( Institute of Digital Technology SAdvanced Instrumentation 9 Zhej iang University 9 ~angzhou 3100279 China ) Abstract : Biochip scanning and analyzing system is guite important to the prevalence of biochip . The traditional system has problems such as compleX architecture 9 unef f icient performance 9 huge f igure . ~owever 9 DSP is an ideal choice for real time applications . The use of DSP / BIOS simpli f ies the DSP sof tware design . Af ter presenting the whole system architecture 9 the article de scribes the DSP sof tware design in detail 9 including the DSP / BIOS application 9 the process of boot 9 scanning control 9 image processing and communication with MPC 823 E . Now this system runs robustly . Key words : digital signal processor ; DSP / BIOS ; DSP sof tware ; biochip analyzing system 生物芯片技术是国际上近年来发展起来的一门 高新技术 . 生物芯片必须用检测设备将芯片测定结 果转换成可供分析处理的图形数据并加以分析 . 因 而 9 生物芯片扫描分析仪是生物芯片能否得到广泛 应用的关键仪器I1I . 本文介绍的生物芯片扫描分析 系统是国家自然科学基金仪器专项研究项目 . 该生 物 芯 片 扫 描 分 析 系 统 将 被 推 广 到 县 级 以 上 各 大 医 院 9 用于临床肝炎的快速准确诊断 . 目前的生物芯片扫描分析系统 9 先由扫描仪采 样得到可供分析的图像数据 9 然后由 PC 机 进 一 步 分析处理 ~ 显示结果和存储数据I2I 9 因而系统复杂 9 处理速度慢 9 体积庞大 . DSP 处理器的引入完成了 扫描控制和数据分析处理 9 是系统的关键创新点 . 本 文介绍的系统以 DSP TMS 320 C 6211 为核心 9 配合 以嵌入式处理器完成图形界面和人机交互功能 9 使 该系统具有可靠性高 9

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