章十微生物的分类和鉴定论述.pptVIP

微生物的分类和鉴定;第一节 通用分类单元;种的概念;种的分类地位举例;二、微生物的学名;(一)双名法;(二) 三名法;(三)有关学名的其它知识;1.属名;2.种名加词;3.学名的发音;三、亚种以下的几个分类单元;（一）亚种;（四）菌株 /品系/毒株/株;亚种以下的分类单元;;一、生物的界级分类学说 二、三域学说及其发展;第二节 微生物在自然界的地位;三原界系统示意图;一、生物的界级分类学说;生物界级学说发展的示意图。阴影部分指微生物。; 1. 二界系统：1753 Linnaeus ; 2.三界系统：1866 Heackel ; 3.五界系统：1969 （Whittaker） ;原核生物 ;导管植物;二、三域学说及其发展 1980（Woese） ;嗜热菌;内共生假说 ;三域学说及其生物进化谱系树; 促使人们提出三原界学说的最重要原因是具有一系列独特性状的曾称作“第三生物”的古细菌的发现。与真细菌相比，古细菌有以下几个特点： 　　（1）细胞膜的类脂特殊古细菌所含的类脂是不可皂化的。其中的中性类脂以类异戊二烯（isoprenoid）类的烃化物为主，极性类脂则以植烷甘油醚（phytanylglycerolethers）为主。 　　（2）细胞壁成分独特而多样有的以蛋白质为主，有的含杂多糖，有的类似于肽聚糖（“假肽聚糖”），但不论是何种成分，它们都不含胞壁酸、D型氨基酸和二氨基庚二酸。 　　（3）核糖体的16SrRNA其核苷酸顺序独特，既不同于真细菌，也不同于真核生物。 　　（4）tRNA成分其核苷酸顺序也很特殊，且不存在胸腺嘧啶。 　　（5）蛋白质合成的起始密码始于甲硫氨酸，与真核生物相同。 　　（6）对抗生素等的敏感性对那些作用于真细菌细胞壁的抗生素如青霉素、头孢霉素和D-环丝氨酸等不敏感；对真细菌的转译有抑制作用的氯霉素不敏感；对真核生物的转译有抑制作用的白喉毒素却十分敏感。 　　（7）生态条件独特有的是严格厌氧菌，如产甲烷菌（metnanogens）；有的是极端嗜盐菌（extremehalophiles）；有的则是嗜热嗜酸菌;;;第三节 各大类微生物的分类系统纲要;各大类微生物的分类系统纲要;一、Bergey 原核生物分类系统纲要; 《伯杰氏系统细菌学手册》 1st ed, 1984-1989, 分为4卷；是在《伯杰氏???定细菌手册》 8th ed 的基础之上增加了大量的分子生物学资料。但由于当时细菌系统发育的资料仍较零碎，所以有相当一部分类群未能科目级别分类，从实际需要出发，主要根据表型特征将整个原核生物分为33组，33个组的划分见表。国际上最为流行的版本。微生物分类技术和学术理论的发展促进了生物科学的进步。 2ed ed, 2000开始出版，分为5卷，提出完整的系统分类，将原核生物分为：古细菌界（2门、5组、8纲、11目、17科、63属、208种）；细菌界：（16门、26组、27纲、62目、163科、814属、4727种）；反映了人们对生物系统发育的深刻认识。 ;;二、Ainsworth等人的菌物分类系统纲要（用菌物代替以往的真菌） 目前广为接受Ainsworth第7版的分类系统及第八版;Ainsworth等人的菌物分类系统纲要;;第四节 微生物分类鉴定的方法;微生物的鉴定;一、微生物分类鉴定的经典方法;（一）经典鉴定指标;;（二）微型、简便、快速、自动化鉴定技术;1.API细菌数值鉴定系统;2.Enterotube 系统（肠管系统）;3.Biolog 全自动和手动细菌鉴定系统;二、微生物分类鉴定中的现代方法;（一）通过核酸分析鉴定微生物遗传型;1.DNA碱基比例的测定;2.核酸分子杂交;;3.rRNA寡核苷酸编目分析;;原理： 水解rRNA，产生很多长短不一的寡核苷酸片段，电泳分离，放射自显影技术获得指纹图谱，确定不同长度寡核苷酸斑点在电泳谱上的位置，找出图谱中链长在6个核苷酸以上的寡核苷酸片段作序列分析，获得的结果进行按不同长度进行编目、列表。通过比较、分析、计算，就可知道各菌株间的亲缘关系大小。若两种或两株微生物的亲缘关系越近，则其产生的寡核苷酸片段的序列也越接近，反之亦然。; 通过T1RNA酶的水解，一般可使rRNA形成含有1～20个核苷酸单位的寡核苷酸片段。如果形象地把只含一个核苷酸的片段称为“字母”的话，则含两个以上核苷酸的片段就成了“单词”。将含有6个“字母”以上的所有“单词”一一测定其核苷酸序列，最后可把它们编成一部“词典”。于是，两个茵株rRNA的相似性就可通过查阅“词典”来作比较。比较的具体方法是计算它们间的缔合系数（associatedcoefficient）或相关系数SA