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微生物,放线菌分类

放线菌的分类 及农业应用;1;7; 有人认为,如果把地球年龄比喻为一年的话,则微生物诞生的时间是在3月20日左右,人类出现的时间是12月31日下午7时左右,所以可以毫不夸张地说,微生物是一切生物(包括人类)的“老前辈”。;经典分类学:按微生物表型特征分类; 1.放线菌分类地位的演变 放线菌最早由Cohn自人泪腺感染病灶中分离到1株丝状病原菌——链丝菌而发现的。由于大多数放线菌具有发育良好的菌丝体,19世纪前人们曾将其归入真菌中。随着科学的发展和新技术的应用,人们对微生物的认识逐渐深入,才将放线菌列于细菌中。;S.A.Waksma; 1968年 Murry 将放线菌入原核生物界厚壁菌门。 《伯杰氏系统细菌学手册》第一版以表观特征将原核生物界分为4个门7个纲,放线菌被列入原核生物界、厚壁菌门、丝状菌纲放线菌目。 Stackebrandt 等根据多年对几百株放线菌与其相近的细菌进行了系统而深入的16 S rDNA/rRNA序列分析,搞清了上述菌的亲缘关系,于l997年提出新的分类系统,建立了放线菌纲。 ; 2001年出版的《伯杰氏系统细菌学手则》第二版把高G+C含量革兰氏阳性细菌确定为放线菌门,放线菌归于细菌域、放线菌门、放线菌纲(亚纲)、放线菌目(亚目)、放线菌科、放线菌属、放线菌种。;2.放线菌的分类;放线菌的分类研究 ;( 1 )形态特征 基内菌丝体的发育程度,是否断裂,有无气生菌丝体和孢子、孢囊、菌核以及其他结构,此外还要说明孢子链、孢子、孢囊、孢囊孢子的形状、大小、数目等;能游动的鞭毛以及鞭毛的位置。 ;; ( 2 )培养特征 放线菌分类中基丝和生孢子气丝的颜色一向受到重视,基丝和可溶色素的颜色为辅新增加的色素对酸碱度是否敏感的方法极具鉴别价值。 ( 3 )生化特征 明胶液化、牛奶凝固和胨化、淀粉水解、纤维素分解或在其上生长、硝酸盐还原等。 ( 4 ) 生态条件 主要是好气与嫌气、腐生与寄生、中温与嗜热(少数嗜低温) 以及对酸碱度(pH)的要求等。;;2.放线菌的数值分类;罗晓霞等人分离塔里木盆地两地区不同生态土壤中的放线菌,并以14个靶标植物病原真菌进行拮抗性测定,筛选出10个具有拮??活性的放线菌菌株,以天蓝色链霉菌、紫色直丝链霉菌为参比菌株进行生理生化特性、 生长条件、 抗生素敏感性、 抗菌活性等 96项指标测定以及数值分类。;2 . 3 放线菌的化学分类;0.38;根据树状图谱和形态与培养特征观察结果 , 可以初步将 10株拮抗放线菌归为链霉菌的 3个 类群和 2个待定种。;3 放线菌的化学分类; 根据肽聚糖的组分和结构的3个特征:四肽链3位上的氨基酸种类,肽桥上有无甘氨酸,肽聚糖中糖的成分。;放线菌全细胞糖模式类型;;(2)磷酸类酯分类 磷酸类酯是位于放线菌细胞膜上的极性类酯,不同属的菌其磷酸类酯组分不同,它是鉴别属的重要依据之一。分类上重要的磷酸类脂有:磷脂酰乙醇胺(PE),磷脂酰甲基乙醇胺(PME),磷脂酰胆碱(PC),磷酸甘油(PG)及含有葡萄糖胺未知组分的磷酸类脂(G luNus)。 (3)醌分类 醌是细胞原生质膜上的组分,在电子传递和氧化磷酸化中起重要作用,放线菌的醌有泛醌( 辅酶 O )和甲基萘醌等。甲基萘醌分子中的多烯侧链长度和3位碳原子上多烯侧链的氢饱和度具有分类学意义。 ;Lechevalier 夫妇分析了48个属典型的磷酸类脂,将放线菌分为6种磷酸类脂类型。;(4)全细胞可溶性蛋白电泳 全细胞可溶性蛋白电泳是在细胞水平进行比较分析。菌体细胞破壁,水解得到全蛋白,经凝胶电泳所得到的图谱,用数字图象仪记录各蛋白的峰值,再用数值分类程序计算各菌株之间的蛋白质图谱相似性,进行分类。这个结果与数值分类和DNA-DNA杂交的结果高度相符 。;4 放线菌的分子分类 ; 2 基于核酸杂交的分析; (2)DNA-r RNA同源性分析 在进化中,rRNA分子的功能几乎保持恒定,而且其分子排列顺序在有些部位变化非常缓慢,保留了祖先的一些序列,即其序列比DNA更保守。这使得 rRNA在分类研究和系统发育上具有DNA-DNA杂交所不可比拟的优越性。一般来说DNA-DNA杂交反映种及亚种水平的信息, 而DNA-rRNA杂交反映的是属与属以上水平的信息。 ;3 基于核酸结构的分析;5 多相分类系统;3 放线菌的应用; 1953 年从我国陕西省泾阳县的苜蓿根土中分离获得的细黄链霉菌( Streptomyces microflavus ) ,用其制成的“ 5406”抗生菌推广的面积最大。 另一种放线菌的活体制剂Mycostop, 是由芬兰的Kemira ( 1989 ) 从泥煤中分离到的灰绿链霉菌( Str

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