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真菌染色体定位新技术1.doc
真菌染色体定位新技术
随着真菌生物学研究的进展,快速准确地将基因组序列定位到染色体上对真菌生物学研究的重要意义日益突出。天津生物芯片公司通过在微生物领域长期技术积累,于2012年引进Argus基因组光学图谱工作仪,并配备了一套用于基因组光学图谱指导序列拼接的软件系统,同时结合已有的微生物图谱信息库,研究出将基因组序列更精确地定位到染色体上的最新测序技术,现该技术将推进真菌以下研究方向:
(1)快速获得真菌基因组物理图谱,纠正真菌基因组拼接中的错误;
(2)辅助拼接,增加基因组拼接的完整性,获得真菌染色体水平拼接结果;
(3)帮助发现真菌菌株之间染色体水平大的遗传变异。
已完成的真菌染色体分析项目
上图为某工业用真菌基因组光学图谱分析结果,共8条染色体。
2012年至今,天津生物芯片技术有限责任公司与南开大学合作建立了基于OpGen公司的Argus系统的基因组光学图谱工作站,并针对细菌、真菌和动植物进行了基因组光学图谱(Optical Mapping)分析,并建立了成熟的从样品处理到结果解析的标准操作流程。
真菌染色体定位新技术主要应用领域
真菌染色体定位主要原理
基因组光学图谱工作原理
组织细胞的获得
基因组DNA的提取
利用光学图谱工作站获得基因组光学图谱
利用测序仪获得基因组序列信息,并模拟图谱信息
利用图谱信息指导序列拼接,并利用迭代方法优化拼接结果
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