第4章节蛋白质共价结构.pptVIP

第4章 蛋白质的共价结构; 蛋白质（protein）是一类最重要的生物大分子，在生物体中占有特殊的地位，与核酸构成细胞内原生质的主要成分。而原生质是生命现象的物质基础。?;4.1.1 蛋白质的化学组成和分类? 化学组成： 碳 50% 氢 7% 氧 23% 氮 16% 硫 0-3% 其他 微量 ?; 单纯蛋白质： 仅由氨基酸组成，如核糖核酸 酶，肌动蛋白。 缀合蛋白质： 除氨基酸外还其他化学成分作 为结构的一部分。称为 (辅基或配体);单纯蛋白还可根据溶解性及其它物理性质进行分类。 缀合蛋白可根据辅基分类。 ;蛋白质还可按生物功能分类，如：;根据形状和溶解度可分为三大类： １)纤维状蛋白质 ２)球状蛋白质 ３)膜蛋白;纤维状蛋白质;球状蛋白质：形状接近球形或椭圆球形，多肽链折叠紧密，疏水的氨基酸侧链位于内部，亲水的在外部，如酶类。 ;膜蛋白：与细胞的各种膜系统结合而存在，为能与膜内的非极性相相互作用，膜蛋白的疏水氨基酸侧链伸向外部。 ; 构象和构型两个术语不应混用 构型：在具有相同结构式的立体异构体中，取代基团在空间的相对取向。不同的构型如果没有共价键的破裂时不能互变的。 构象：指具有相同结构式和相同构型的分子在空间里可能的多种形态。构象的改变不涉及共价键的断裂。;蛋白质的一级结构 蛋白质的二级结构 蛋白质的三级结构 蛋白质的四级结构 ;4.1.4 蛋白质功能的多样性;; ６）结构成分---结构蛋白的单体一般聚合成纤维状如胶原蛋白。 ７）支架作用---支架蛋白常含有多个不同的组件，在它上面可将多种不同蛋白质组装成一个多蛋白复合体，这种复合体参与对激素和其它信号分子的胞内应答的协调和通讯。 在细胞应答激素和生长因子的复杂途径中起作用。 ８）防御和进攻---免疫球蛋白（抗体）、血液凝固蛋白、抗冻蛋白、蛇毒和蜂毒的溶血蛋白、植物毒素、细菌毒素。 ９）异常功能蛋白---甜蛋白、节肢弹性蛋白等。;4.2 肽 肽是氨基酸的线型聚合物，也称肽链（peptide chain） 　;;4.2.1 肽和肽键的结构 蛋白质??氨基酸的连接方式是肽键，实验证据有： 蛋白质分子中游离α-氨基和α-羧基是很少的。 某些人工合成的多肽能被水解蛋白质的蛋白酶所水解。 双缩脲颜色反应 X射线衍射图案 二肽(dipeptide)、寡肽(oligopeptide)、多肽(polypeptide)、氨基酸残基(aminoacid residue)、末端氨基、环状肽(cyclic peptide) ;规定从肽链的NH2为某氨基酰某氨基酰……某氨基酸。 Ser—Gly—Tyr—Ala—Leu 通常在总是把NH2末端氨基酸残基放在左边，COOH末端氨基酸残基放在右边，除特别指明者外。 肽链的骨干是由—N—Ca—C---序列重复排列而成，称为共价主链。 ;由于酰胺氮上的孤电子对离域与羰基轨道重叠，因此在酰胺氮和羰基氧之间发生共振相互作用(resonance interaction)。 ;肽键共振产生几个重要结果： ①限制绕肽键的自由旋转。 ②组成肽基的4个原子和2个相邻的C形成所谓多肽主链的酰胺平面(amide plane)，也称肽基平面或肽平面。 ③C==N键长度为0.133nm。估计C—N键具有约40%双键性质。由于C—N具有部分双键性质，绕键旋转的能障比较高。对肽键来说，这一能障在室温下足以防止旋转，保持酰胺基处于平面。 ④肽键具有永久偶极。 ;;肽平面;4.2.2 肽的物理和化学性质 短肽的晶体是离子晶格，在水溶液中以偶极离子存在。 在pH0—14范围内，肽键中的酰胺氢不解离。 4.2.3 天然存在的活性肽 α—鹅膏蕈碱 还原型谷胱甘肽(reduced glutathione)即γ—谷氨酰半胱氨酰甘氨酸;还原型和氧化型谷胱甘肽;4.3 蛋白质一级结构的测定 蛋白质的共价结构也称蛋白质的一级结构，一般看作是氨基酸序列的同义语。 现在已知约200000个不同蛋白质的氨基酸序列，相当一部分使用Sanger法测定的，现在大多数是根据编码蛋白质的基因核苷酸序列推导出来的。;4.3.1 蛋白质测序的策略 纯度应在97%以上，同时必须知道它的相对分子质量。 ①???? 测定蛋白质分子中多肽链的数目 ②???? 拆分蛋白质分子的多肽链（若是寡聚蛋白 则需用变性剂 8mol/L尿素，6mol/L盐酸胍