第讲药物设计理论与方法.pptVIP

下载本文档

32
0
约小于1千字
约 81页
2017-04-23 发布于四川
举报
版权申诉

第讲药物设计理论与方法.ppt

1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

第讲药物设计理论与方法

药物设计学;第三章基于结构的药物设计;基于结构的药物设计（计算机辅助药物设计）;第一节计算机辅助药物设计的基本理论和方法;思考题;一、基于药物-靶标相互作用的药物设计;1、已有药物-靶结合作用的增强;*;*;*;结合基团位置的变化;*;结合基团电子性质的变化;*;2、增加新的药物-靶结合作用;*;3、复杂分子的结构简化;注意;4、柔性结构的构象限制;*;二、类药性预测方法与初步虚拟筛选;*;1、类药性预测方法;（2）Linpinski五倍率法;五规则对一些化合物的预测;一些药物化学家还仿照里宾斯基五规则提出了用于筛选类先导化合物的五规则：;（3）Ghose法和Oprea法;（4）类药指数法;2、初步虚拟筛选方法;*;常见的毒性骨架结构和毒性部位或类型;*;（3）与已知药物的骨架和侧链比较;三、分子三维结构表示;*;1、分子结构的表示;*;*;Surfaces(/Science/Compchem/feature14.html);Examples;Tryptophan: Molecular Surface;Hierarchy Model of Protein Structure;蛋白结构的表示;2、分子三维结构信息的获得;*;*;*;*;量子化学（quantum chemistry）;*;*;*;分子力学方法;*;Steric Energy;常用的分子力场;Angle Bending;Uses of “Steric Energy”;Successes of MM Calculations;A General Force Field Calculation;*;*;*;3、Energy Minimization（能量优化）;*;*;*;基于导数能量最小化方法总结;*;Conformational Search Outline;构象搜索法;系统搜索法（systematic searching），系统地搜索整个构象空间，寻找能量最低点。该法在搜索条件的参数下不会遗漏一个构象。最基本的系统搜索法是网格搜索（grid search），也称为树状搜索（tree search）。;非系统搜索法;非系统搜索法;非系统搜索法;理论计算获得一个分子最低能量构象的步骤;*;绘制分子结构;绘制结构式;*;*