第10章微生物的分类鉴定选编.pptVIP

第10章 微生物的分类和鉴定;形成于35亿年前的微生物化石 主要是些类似简单杆状细菌的原始生物;形成于10亿年前的微生物化石;今天仍生存在地球上的生物种类， 彼此之间都有或远或近的历史渊源。;生物分类的二种基本原则：;第一节 细菌分类;命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有 的名称；;一、分类单元及其等级;常用的细菌分类学术语：;Bacillus subtilisASI.398;;3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌 株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。;伯杰氏手册;1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如1974年第八版，撰稿人多达130多位，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近20个国家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐??立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。;《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology);二、微生物的命名;Pseudomonas aeruginosa;二、微生物的命名;第二节、细菌分类鉴定的特征和技术;一、形态学特征;二、生理生化特征;二、生理生化特征;形态和生理生化特征是最常用 的细菌分类、鉴定指标;三、核酸的碱基组成和分子杂交;1. DNA的碱基组成(G+Cmol%);1）每个生物种都有特定的GC%范围，因此后者 可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围 为25--75%，变化范围最大，因此更适合于细 菌的分类鉴定。;2）GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，并可检验表型特征分类的合理性， 从分子水平上判断物种的亲缘关系。;同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下； 同属不同种的差别应低于10～15%； G+C含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项 基本特征，它对于种、属甚至科的分类鉴定有重要意义。;80年代以前螺菌属(Spirillum)不同种的G+C含量范围宽达38～66%， 后来“伯杰氏手册”(1984)结合其他特征已将其分成三个属：螺菌属、 海洋螺菌属(Oceanospirillum)和水螺菌属(Aquaspirillum) 它们G+C含量分别为38%、42～51%和49～66%；;在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的 分类单位时，G+C含量是一项重要的，必不 可少的鉴定指标。;2. 核酸的分子杂交;特异性的探针主要用于 病原微生物的快速鉴定;3．电子杂交;四、其它;血清学试验 （凝集反应）;通过氨基酸顺序判断细菌间的亲缘关系;利用16S rDNA序列对微生物进行鉴定;微生物的16Sr DNA序列具有进化上的保守性，因此可作为分类的良好依据。;基于16S rDNA序列同源性的脱氮细菌系统发育树 ;培养微生物;BIOLOG自动微生物鉴定系统;BIOLOG公司以其专利技术开发的微生物鉴定系统，以检测微生物细胞利用不同碳源进行新陈代谢过程中产生的酶与四唑类物质（如TTC、TV）发生颜色反应和浊度差异为基础，运用独有的显型排列技术检测出每种微生物的特征指纹图谱，在大量试验和数学模型基础上，建立起指纹图谱与微生物种类相对应的数据库。检测时通过智能软件将待鉴定微生物的图谱与数据库参比，即可得出鉴定结果。;;鉴定步骤;鉴定的微生物种类与所耗时间