森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆.pdfVIP

1630 植物生理学报 PlantPhysiologyJournal2014，50(11)：1630~1638 doi：10．13592~．cnki．ppJ．2014．0295 森林草莓全基 因组MADS．box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实 FaMADS1基因克隆 周厚成 。’，李刚，赵霞 ，康兆茹 ，郭蔼光 中国农业科学院郑州1果树研究所，郑卅[450009；。西北农林科技大学生命科学学院，陕西杨凌712100 摘要：本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragariavesca)基因组数据库 MADS．box基因的数量、结构类型、序列特征 及染色体定位进行分析。结果表明，获得70个含SRF．TF结构域的森林草：~FvMADS基因，DNA长度289～14596bp，编码 66～1437个氨基酸残基，有21个FvMADS没有内含子，在7条染色体上呈不均匀分布；68个FvMADS蛋白序列含有保守基序 Motif1，最佳匹配序列为 “RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF”。另外，从栽培品种 丰‘香’草莓果 实中克隆了FaMADS1基因，该基因属于MADS．box基因家族，cDNA全长1167bp，编码区750bp，推导编码249个氨基酸，具 有MADS结构域和K．box结构域 。 关键词：草莓；MADS—box；转录因子；生物信息学；FaMADS1基因 Genome-W ideSequenceIdentificationofM ADS-BoxTranscriptionFactorGene Familyfrom FragariavescaandCloningofFaMADS1generfom E ananassaFruit ZHOUHou．Cheng，’，LIGang，ZHAOXia，KANGZhao．Ru，GUOAi．Guang |ZhengzhouFruitResearchInstitute ChineseAcademyofAgriculturalSciencesZhengzhou450009．China,2CollegeofL啦Sci ． ences．NorthwestA ＆FUniversity,Yangling,Shaanxi712104 China Abstract：InthisPaDerMADS．boxgeneswereobtainedbyFragariavescagenomedatabasequeryandnamed Fv』4D ．MADS—boxgenesfamily，includingthenumberoftheFvMADSgenes。structuretype，sequencechar． acteristicandchromosomallocalization．wasanalyzedbyusingbioinofrmaticsmethods．Theresultsshowed that70 A D genesincludingSI ．TFstructuredomainwereobtained．These 4DSgenefamilyDNA sequencewere289-14596bpinlengthandencoded66-1437aminoacidresidues．and21FvMADSgeneshad nointrons．Thesegeneswerenotevenlydistributedon7chromosomes．68FvMADSproteinscontainedacon— servedbasesequenceMotif1ofthebestmatchingsequencesfor“RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAE— VALIIFSSRGKLYEF”．Inaddition．the D genefromF ananassaCV．T‘oyonoka’fruitwascloned．The genewhichbelongedtoMADS-boxgenefamily,thefull—lengthcDNA Of1167bpencoding249aminoacids． wasderivedbyMADSandK．boxsturcturedomains． Keywords：Fragaria；MADS—box；transcriptionfactor；bioinofrmatics；FaMADsigene 植物MADS—box基因家族数量众多，功能多 有70个氨基酸，