甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析.pdfVIP

144 广东农业科学 2014年第 12期 甜瓜 一甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析 乌斯呼吉 日嘎拉 ，赵爱奇，莘少红，郝金凤，哈斯阿古拉 (内蒙古大学生命科学学院／内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室，内蒙古 呼和浩特 010021) 摘 要 ： 一甘露糖苷酶(仅一mannosidases， —Man)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶。通过 已公布的甜瓜基因 组数据库预测 —Man基因家族成员 ，其蛋白序列都含有完整的 Glyco hydro_47或 Glyco—hydro一38保守结构域 。再将 筛选出的成员与拟南芥、大豆、番茄 、可可树 、葡萄 、黄瓜 、马铃薯 、谷子的相应基因编码 的蛋 白序列进行进化分析比 对 ．建立系统发生树和保守基序的预测分析。结果表 明，甜瓜基因组中含有 8个 —man基因，分为 I类和 Ⅱ类，并分 成 5个亚族。同一类成员的蛋 白结构域具有较高相似性与保守性 ，并且大部分成员基序的顺序和种类相 同，不 同类 的成员之间基序差距较大 。对甜瓜 一甘露糖苷酶基 因家族的系统分析鉴定，有助于甜瓜 d一甘露糖苷酶基因克隆和 功能的进一步研究，为研究其他植物 一甘露糖苷酶基因家族的功能和进化提供参考依据。 关键词 ：甜瓜 ：oL一甘露糖苷酶 ：进化分析：生物信息学 中图分类号：Q941 文献标识码 ：A 文章编号 ：1004—874X(2014)12—0144—06 』 ●1 ■ ■ ■ ●1 U en0m e-wine analysis ot0【一m annoSlnases n ■- ● ● T Iam ily genes in L。UCUm Z m ￡O Usukhjargal，ZHAO Ai-qi，SHEN Shao-hong，HAO Jin-feng，HASI Agula (Colege ofLife Science$，InnerMongolia University~InnerMongoliaKeyLaboratory ofHerbageEndemic Crop Biotechnology,Hohhot 010021．China) Abstract： —mannosidases(a-Man)，one group of glycosidases，have been universaly distributed among most types of living organisms．Based on the published database of melon fCILCumi$melo)。we found the 0l—Man family genes containing complete Glyco_ hydro_ 47 or Glyco_ hydro— — 38 domain．These protein sequences were analyzed by multi-sequence aligned， which are similar in A rabidopsis tha!iana,Glycine m似，Solanum lycopersicum,Theobroma cacao，Vitis vinifero,e sativus， S．tuberosum and Setaria italic．And the structure evolution relation and conserved motifs were researched by bioinformatics method．The results indicated that the melon genome containd 8 0【一Man genes divided into class I and class II or 5 subfamilies．This protein was highly conservative with domain in the same class．Moreover，most of them had the same motifs in same order．On the contrary，the members of different classes had less similarity each other．This study is helpful for cloning and clarifying the function of 一Man genes in melon．and can provide the diverse reference of the function and evolution for a-mannosidase