第七章分子标记辅助选择选编.pptVIP

第七章 分子标记辅助选择;选择是指在一个群体中选择符合要求的基因型。 传统育种通过表现型间接对基因型进行选择，存在许多缺陷。 分子标记为实现对基因型的直接选择提供了可能，通过对分子标记基因型的检测，就能获知目标基因的基因型。 借助分子标记对目标性状的基因型进行选择，这称为标记辅助选择(MAS);分子标记辅助选择的优越性 ;4、允许更广泛和强度更大的选择 对幼苗的选择还可以允许把更多的群体纳入研究选择的对象之中，从而可以对其施加更大强度的选择压力。同时，还可利用分子标记同时对几个性状（如几种抗病虫性和产量）进行选择。 5、可进行非破坏性性状评价和选择 利用分子标记技术只需少量叶片或其它组织，植株还可继续生长至成熟，以便育种工作者同时对该育种群体进行其它性状的选择 ;6、可提高回交育种效率 利用传统回交方法将一个野生种的优良基因转移到栽培品种中，回交20代以上还有可能带有100个以上的其它非期望基因。如果是数量性状位点（QTL）的转移，由于上位效应问题和连锁累赘更为复杂，将更加困难。 利用分子标记可以允许选择出那些含有重组染色体（打破了连锁累赘）的个体，从而帮助减小不需要的染色体片断，从而提高育种效率至少10倍以上。另外，对隐性性状可以进行不间断的回交（传统回交中是隔代回交），从而提高基因的回交转移速度。 ;进行分子标记辅助选择的前提;2、把目标基因定位于分子图谱上： 分子标记辅助选择的可靠程度取决于目的性状座位与标记座位之间的重组频率，因此二者之间的遗传距离越小越好。与目的基因紧密连锁的单一分子标记可以用于辅助选择，而如果在目的基因两侧均能找到与之连锁的标记，会进一步提高选择的可靠性。 由于在15－20cM的距离内很难发生两个重组事件（双交换），因此现在一般认为如果目标基因位于两个距离在15－20cM以下的分子标记之间，这两个标记便可以用于育种项目。 ;3、检测的自动化： 由于分子标记辅助选择要求对育种群体进行大规模检测，因而要求检测的方法要简单、快速、成本低、比较准确，也要求检测过程（包括DNA的提取、分子标记的检测、数据分析等）自动化。 ;一、质量性状的标记辅助选择;1、前景选择;1）、单标记选择;如果不要求中选的所有单株都是正确的，而只要求在选中的植株中至少有一株是具有目标基因型的，那么，即使标记只是松弛地与目标基因连锁的，对选择仍然会很有帮助。;中选植株中至少有一株是具有目标基因型的概率与中选株数的关系：;2）、双标记选择;在单交换间无干扰的情况下，在F2代通过选择标记基因型MlM2/MlM2而获得目标基因型Q／Q的概率为：;标记与目标基因间的重组率与F2群体中标记辅助选择正确率的关系;标记与目标基因间的重组率与F2群体中标记辅助选择最小应选株数的关系;2、背景选择;从一条染色体看，如果两个相邻标记座位上的等位基因来自不同的亲本，则说明在这两个标记之间的染色体区段上发生了单交换或更高的奇数次交换。 如果两标记座位上的等位基因来自同一个亲本，则可近似认为这两个标记之间的染色体区段也来自这个亲本，因为在这种情况下，该区段上只可能发生偶数次交换，而即使是最低的偶数次交换(即双交换)，其发生的概率也是很小的。;根据两个相邻标记的基因型来推测出它们之间染色体区段的来源和组成。;根据相邻标记可以推测出一个反映全基因组组成状况的连续的基因型，这种连续的基因型能直观地用图形表示出来，称为图示基因型。;根据图示基因型，可以同时对前景和背景进行选择。应首先进行前景选择，以保证不丢失目标基因，然后再对中选的个体进一步进行背景选择，以加快育种进程。;3、基因聚合;3个抗稻瘟病基因(Pi-2、Pi-1和Pi-4)的基因聚合;2）基因聚合;4、基因转移;基因转移的过程需同时进行前景选择和背景选择。 前景选择的作用是保证从每一回交世代选出的作为下一轮回交亲本的个体都包含目标基因，而背景选择则是为了： (1)加快遗传背景恢复成轮回亲本基因组的速度，以缩短育种年限。;(a)轮回亲本基因组在回交后代中的恢复速率;(b)轮回亲本基因组在目标基因邻近区域的恢复速率;(2)背景选择可以避免或减轻连锁累赘;只含一个供体基因，淘汰;二、数量性状的标记辅助选择;数量性状选择的方法;以个体标记值为依据的选择称为标记值选择。 利用完整的分子标记连锁图进行QTL定位分析，原则上能够估计出个体的加性效应值。但要得到个体加性效应值的精确估值，必须进行QTL的精细定位。 在加性模型下，性状—标记回归方程为：;应用逐步回归分析可以筛选出对目标性状效应明显的标记，然后将它们的加性效应估值算出个体的标记值 个体的标记值为：;3、指数选择;选择指数也是对加性效应值的一种近似值，其近似程度取决于它的遗传力;不论是标记值选择还是指数选择，都只在