上海地区人类免疫缺陷病毒1型感染者原发耐药基因及亚型分析 (1).pdfVIP

· ?·? 微 生 物与感 染 ?????????????????????????????????，????????，????，????：????? ????：／／???．?????．???．??? · 论 著 ·? 上 海 地 区 人 类 免疫 缺 陷病 毒 ?型 感 染 者 原 发 耐 药 基 因? 及 亚型 分 析? 刘莉?，马建新?，郑毓 芳?，张仁 芳?，沈银 忠?，李莉?，陈军?，王珍 燕?，孙 富艳?，? 卢 洪 洲? 门? ?．上海市 ?复旦大学附属?公共卫 生临床 中心感染 科 ，上海 ??????；??．复旦 大学 附属华 山 医院感染 科 ，上海? ??????；?．复旦 大学 上海 医学院内科学系 ，上海 ??????? 摘 要 ：本文通过对未经抗病 毒治 疗患 者 的人类 免疫 缺 陷病毒 ?型????一??毒 株进 行检 测 ，了解 上海 地 区? ???一?的亚型分布及原发耐药基 因变异现状 。对 ???例未经 治疗的 ???感 染者标 本 中 ??? 蛋 白酶全长 和? 部分 反转 录酶基因进行反转录?聚合酶链反应 ???—????扩 增 ，经 ??? 测序后 ，进行 系统进 化树分 析和重组? 分析 ，以确定 ???一?基 因亚 型和 重组 体 ，并 与 斯 坦福 耐 药 数 据库 比对 ，了解 耐 药 突变 位 点 。使 用 斯 坦福? ???? ???亚 型分 型工具 和美 国国立 生物技术 信息中心?????????亚 型分析工具分 析 ，获得 ???例 患者的? ???基冈序列 ，基 因分型分别为 ?????一??重组体 ??例 ???．?％?、?亚型 ??例 ???．?％?、???????????例? ???．?％ ?、????? 一 ????例 ??．?％?、?亚 型 ?例 ??．?％?，亚型问或重组 体 间二 重重组 体 ??／????】??????例? ??．?％?。蛋 白酶抑制剂 ????和反转录酶抑制剂相关 的耐药基 因突变率达 ??．?％???／????，其中 ?例 ??．?％?? 发生 ??耐药 ，基因突变位点 ：????、????。?例 ??．?％?对 反转 录酶抑制剂 产生耐 药 ，其 中对 核苷类 反转 录? 酶抑制剂 ??????和非核苷类反转录酶抑制剂 ???????的耐 药率分 别为 ?例 ??．?％?和 ?例 ??．?％ ?。基 因? 突 变 位 点 ：????为 ????、????、????／?／?、????、????、????