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【2017年整理】ch03 基因工程工具酶
Chapter 03 基因工程工具酶;§3.1 限制性内切酶
§3.2 DNA 聚合酶
§3.3 其他分子克隆工具酶 ;3.1限制性内切酶(Restriction Endonuclease);3.1.2 限制性核酸内切酶的概念
是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸水解酶。
至2006年2月共发现3773种限制性内切酶,I、II、III型各有68、3692、10种,甲基化指导的3种,商品化的609种,II型中共有223种特异性。;Evaluation only.
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Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;① 第一个字母(大写,斜体)代表该酶的宿主菌属名(genus)
② 第二、三个字母(小写,斜体)代表宿主菌种名(species)
③ 第四个字母代表宿主菌的株或型(strain)
④ 罗马字母表示发现和分离的先后顺序;限制性核酸内切酶的命名原则:
属名 种名 株名
Haemophilus influenzae d 流感嗜血杆菌d株
HindⅡ HindⅢ
同一菌株中所含的多个不同的限制性核酸内切酶;
Ⅱ 型(type Ⅱ): 限制酶一般是同源二聚体,修饰酶是单体, 93%
Ⅰ 型(type Ⅰ): 限制酶、甲基化酶识别 DNA 序列的 S 亚基 , 1%
Ⅲ 型(type Ⅲ):不到 1% ;3.1.5 限制酶识别的序列 ;Evaluation only.
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Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;限制酶识别序列的结构 ;3.1.5.3 酶切位点;3.1.6 限制酶产生的末端;;;;Tris-HCl 50mmol/L pH7.5
MgCl2 10mmol/L
NaCl 0-100mmol/L
DTT 1mmol/L
Volume 20-100μL
Temperature 37℃
Time 1-1.5h
◆1个单位限制性核酸内切酶;3.1.7.1 缓冲液
常规缓冲液一般包括提供稳定 pH 值(7.0-7.9 )的缓冲剂、 Mg++ 、 DTT(二硫苏糖醇)以及 BSA。
3.1.7.2 反应温度
大多数为 37℃;3.1.7.3 反应时间??? 反应时间通常为 1 小时或更多,许多酶延长反应时间可减少酶的用量。
3.1.7.4 终止酶切的方法
EDTA
加热;① DNA样品的纯度
② DNA样品的甲基化程度
③ 酶切反应的温度
④ DNA分子结构(底物构象)
⑤ 核酸内切酶的缓冲液;Ⅱ限制性核酸内切酶的星活性(star activity)
在极端非标准反应条件下,限制性核酸内切酶能切割与特异识别序列相似的序列,降低酶切反应的???异性,这种改变的特殊性称为限制性核酸内切酶的星活性。;星星活性产生的原因如下:
① 反应体系中甘油的浓度过高
② 酶用量过大
③ 低离子强度
④ 高pH
⑤ 含有机溶剂
⑥ 非Mg2+的二价离子的存在。;① 在特异位点上切割DNA,产生特异的限制性酶片段
② 建立DNA分子的限制酶图谱
③ 构建基因文库
④ 用限制酶切出的相同粘性末端,以便重组
⑤ 改建质粒;
① 每次操作时应使用新的吸头去取酶,加入酶的体积应不超过总体积的10%
② 整个操作应在0℃进行,最后加入酶
③ 切割大量DNA时,延长反应时间,减少酶的用量
④ 应用通用缓冲液;3.2 DNA 聚合酶 (DNA polymerase);Evaluation only.
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Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;3.2.1.2 E.coli DNA 聚合酶 Ⅰ 的用途;Evaluation only.
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Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;3.2.2 Klenow DNA 聚合酶
(1)Klenow酶
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