CHAPTER 4 翻译.ppt

What is translation? 蛋白质的翻译概述 翻译过程： 翻译的起始(核糖体与mRNA结合并与氨酰-tRNA生成起始复合物)。 肽链的延伸(核糖体从5’-3’即N端-C端合成多肽)。 肽链的终止及释放(核糖体从mRNA上解离，准备新一轮合成反应)。 翻译机器：核糖体、mRNA、tRNA、氨酰-tRNA合成酶等 OUTLINE 4.1 三联子密码及mRNA的5‘端结构 4.2 tRNA 4.3 核糖体 4.4 原核生物蛋白质合成的过程 4.5 真核生物蛋白质合成的过程 4.6 翻译的调控 4.7 新生肽的加工和折叠 4.8 蛋白质运转机制 4.1 三联子密码 密码子:mRNA上3个核苷酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸，这3个核苷酸就称为密码子。 ORF: 从mRNA 5‘端起始密码子AUG到3’ 端终止密码子之间的核苷酸序列，各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链，称为开放阅读框架(open reading frame, ORF)。 反密码子：tRNA分子的反密码子环上的三联体核苷酸残基序列。在翻译期间，反密码子与mRNA中的密码子互补结合。 遗传密码的性质 简并性(degeneracy)：由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象。61个编码氨基酸，3个终止密码子UAA(赭石)，UAG(琥珀)，UGA(蛋白石)。 普遍性和特殊性: 密码子对各种生物都适用，支原体中UGA编码色氨酸，嗜热四膜虫中UAA编码谷氨酰胺。 反密码子Wobble hypothesis 任意一个密码子的前两位碱基都与tRNA anticodon中的相应碱基形成Watson-Crick碱基配对。 反密码子第一位是A或C时，只能识别一个密码子。当反密码子第一位是U或G时，能识别两个密码子。当Inosine(I,次黄嘌呤核苷)作为反密码子第一位时，能识别三个密码子。 如果数个密码子同时编码一个氨基酸，凡是第一、二位碱基不相同的密码子都对应于各自的tRNA。 密码子与反密码子配对的摆动现象 原核mRNA的5’端序列 多顺反子，含有几个蛋白质的编码序列，在5‘端非编码区有控制翻译的关键序列： 在起始密码子AUG上游的9-13个核苷酸有一段可受核糖体结合、保护和富含嘌呤的3-9个核苷酸共同序列，一般为AGGA，称为SD序列。 SD与核糖体小亚基内16S rRNA的3’端一段富含嘧啶的序列形成互补，使得结合于30S亚基上的起始tRNA正确定位于mRNA的起始密码子AUG。 真核mRNA的5’端序列 真核mRNA5‘端具有m7GpppN的帽子结构，缺乏SD序列，只有当甲基化形成帽子结构时才能有效翻译。 5’端非翻译区存在碱基配对形成发夹结构时，就会阻遏核糖体40S亚基的移动。 如果AUG与帽子结构之间距离太短(12bp)，就不能有效利用此AUG，寻找下一个AUG。 Prokaryotic mRNAs have a ribosome binding site that recruits the translational machinery Ribosome binding site (RBS) or SD-sequence in prokaryotic mRNA, complementary with the sequence at the 3’ end of 16S rRNA. Once Eukaryotic mRNA uses a methylated cap to recruit the ribosome. Once bound, the ribosome scans the mRNA in a 5’-3’ direction to find the AUG start codon. Kozak sequence increases the translation efficiency.(G/N-C/N-C/N-ANNATGG) Poly-A in the 3’ end promotes the efficient recycling of ribosomes Translation: ribosome cycle 4.2 tRNA tRNAs share a common secondary structure that resembles a cloverleaf The cloverleaf structure is a common secondary structural representation of tRNA molecules which shows the base paring of various regions to form four stems (arms) and three loops.