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蛋白质结构与功能精要
蛋白质的主要生理功能 生物体内的氨基酸类别 (一)氨基酸的分类 构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220nm)均有光吸收。 在近紫外区(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。 酪氨酸的?max=275nm,?275=1.4x103; 苯丙氨酸的?max=257nm,?257=2.0x102; 色氨酸的?max=280nm,?280=5.6x103; 氨基酸与茚三酮反应 氨基酸与苯异硫氰酯(PITC)的反应(Edman反应) 氨基酸与2,4一二硝基氟苯(DNFB)的反应(sanger反应) 肽 肽和肽键的形成 肽键的特点: 肽键的特点: 氨基酸在形成肽链时丢失了一分子水,肽链中的氨基酸分子已不完整, 谷胱甘肽 由下丘脑分泌,其功能是促进腺垂体释放促甲状腺素(调节糖代谢)。 蛋白质结构的主要层次 一、蛋白质的一级结构 蛋白质一级结构的概念: 蛋白质分子中所有氨基酸的排列顺序,称~ 一级结构中的主要化学键: 肽键,二硫键 氨基酸序列书写: 以氨基末端开始~羧基末端结束,依次编1、2、3……… 一级结构测定 蛋白质顺序测 定基本战略 二、蛋白质二级结构 概念: 是指蛋白质分子中一段多肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及到aa侧链R基团的构象。 肽单元(肽平面): 肽键的6个原子Cα1 、C、N、O、H、 C α2位于同一平面,构成所谓的肽单元 肽单位 酰胺平面与α-碳原子的二面角( φ和ψ ) 完全伸展的多肽主链构象 蛋白质的二级结构类型 (二)β-折叠(β-pleated sheet) 故又称β-折叠片或β-片层。 2. β-折叠结构特点 (三)β-转角(β-turn) (五) 蛋白质的超二级结构和结构域 超二级结构类型 三 蛋白质的三级结构 卵溶菌酶的三级结构中的两个结构域 维持蛋白质分子构象的作用力a.盐键 b.氢键 c.疏水键 d.范得华力 e.二硫键 四 蛋白质的四级结构(quaternary structure) 正常红细胞与镰刀形红细胞的扫描电镜图 不同生物与人的Cytc的AA差异数目 不同生物来源的细胞色素c中不变的AA残基 血红蛋白输氧功能和构象变化 核糖核酸酶变性与复性作用 (四)蛋白质主要呈色反应 双缩脲反应 (五)蛋白质的紫外吸收光谱 二、 蛋白质的分离纯化 (四) 层析 层析种类: 凝胶过滤(分子筛) 离子交换层析(阴离子和阳离子) 亲和层析 四、肽与蛋白质的人工合成 1.原料 aa 2. 保护剂 与-NH2或-COOH 反应,易去掉 3.缩合剂 4.-COOH 、-NH2活化剂 合成步骤 α-NH2和α-COOH 的保护与活化 接肽反应 脱去保护剂 四、蛋白质空间结构的测定 本章小节 蛋白质的生物学作用:功能蛋白、结构蛋白 蛋白质的组成(元素组成、化学组成)及蛋白质含量的测定 二十种氨基酸的结构、分类及名称(三字缩写符、单字缩写符) 氨基酸的重要理化性质:两性解离、茚三酮显色、与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应 蛋白质的一级结构:肽、肽键、活性多肽及一级结构的测定 蛋白质的空间结构:二级结构单元( ?-螺旋、?-折叠、 ?-转角、自由回转)、三级与四级结构(超二级结构、结构域、亚基)及结构与功能的关系 蛋白质的性质:大分子性质、蛋白质分子量的测定(离心法、凝胶过滤法、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法)、两性解离(等电点、电泳、离子交换)、胶体性质、蛋白质沉淀(可逆沉淀、不可逆沉淀)、蛋白质变性、紫外吸收及颜色反应 蛋白质的分类:按外形及组成分类 问 题 1. X射线晶体衍射法 X-衍射图代表射线穿过(蛋白质)晶体的一系列平行剖面的各原子的电子密度,然后再借助计算机绘制出三维的电子密度图。 2.二维磁共振技术 3. 蛋白质空间结构的预测 (1)根据分子力学、分子动力学、物理化学原理,从理论上计算推测蛋白质的空间结构 (2)从已知蛋白空间结构规律,从一级结构推测空间结构。 Native ribonuclease Denative reduced ribonuclease Native ribonuclease 8 M urea and ?-mercapotoethanol Dialysis 变性 复性 当破坏了维持蛋白质胶体稳定的因素甚至蛋白质的构象时,蛋白质就会从溶液中析出,这种现象称为蛋白质的沉淀。 2. 蛋白质的沉淀(pre-cipitation) 概念: 应用: (1)蛋白质分离纯化 (2)解毒 (3)临床检验 (1) 盐析法( salting out)
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