Functional Enhancers at the Gene-Poor 8q24 Cancer-Linked Locus 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Functional Enhancers at the Gene-Poor 8q24 Cancer-Linked Locus 英文参考文献.doc

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Functional Enhancers at the Gene-Poor 8q24 Cancer-Linked Locus 英文参考文献

FunctionalEnhancersattheGene-Poor8q24Cancer- LinkedLocus LiJia1,2.,GiladLandan3.,MarkPomerantz4,RamiJaschek3,PaulaHerman4,DavidReich5,ChunliYan1, OmarKhalid1,2,PhilKantoff4,WilliamOh4,J.RobertManak6,BenjaminP.Berman7,BrianE.Henderson1, BaruchFrenkel8,ChristopherA.Haiman1,MatthewFreedman4,9,AmosTanay3*,GerhardA.Coetzee1,2* 1USC/NorrisCancerCenter,Department ofPreventive Medicine, University ofSouthernCalifornia,Los Angeles,California,United States ofAmerica,2Department of Urology,UniversityofSouthernCalifornia,LosAngeles,California,UnitedStatesofAmerica,3DepartmentofComputerScienceandAppliedMathematics,Weizmann InstituteofScience,Rehovot,Israel,4Dana-FarberCancerInstitute,DepartmentofMedicalOncology,HarvardMedicalSchool,Boston,Massachusetts,UnitedStatesof America,5DepartmentofGenetics,HarvardMedicalSchool,Boston, Massachusetts,UnitedStatesofAmerica,6DepartmentofBiology,UniversityofIowa,IowaCity, Iowa,UnitedStatesofAmerica,7USC/EpigenomeCenter,KeckSchoolofMedicine,UniversityofSouthernCalifornia,LosAngeles,California,UnitedStatesofAmerica, 8DepartmentofOrthopedicSurgeryandDepartmentofBiochemistryandMolecularBiology,InstituteofGeneticMedicine,UniversityofSouthernCalifornia,LosAngeles, California,UnitedStatesofAmerica,9BroadInstituteofHarvardandMIT,Cambridge,Massachusetts,UnitedStatesofAmerica Abstract Multiplediscreteregionsat8q24wererecentlyshowntocontainallelesthatpredisposetomanycancersincludingprostate, breast,andcolon.Theseregionsarefarfromanyannotatedgeneandtheirbiologicalactivitieshavebeenunknown.Here weprofileda5-megabasechromatinsegmentencompassingalltheriskregionsforRNAexpression,histonemodifications, and locations occupied by RNA polymerase II and androgen receptor (AR). This led to the identification of several transcriptionalenhancers,whichwereverifiedusingreporterassays.TwoenhancersinoneriskregionwereoccupiedbyAR andrespondedtoandrogentreatment;onecontainedasinglenucleotidepolymorphism(rthatresideswithina FoxA1 binding site, with the pr