第5章 转录与转录后加工(上).ppt

TATAAT→AATAAT，转录效率下降,称为下降突变（down mutation）。 TATGTT→TATATT，转录效率上升，为上升突变（up mutation）。 -10序列对转录的效率影响 * 3.-35 序列 其保守序列为： T85T83G81A61C69A52 --- -35 box 功能:RNA pol的识别位点。σ亚基识别-35序列，为转录选择模板. 4.作用部位和间隔区 -35和-10序列的距离是稳定的，此与RNA pol的结构有关。两序列之间距离为17bp最强。 * 5.CAP 结合位点 环腺苷酸受体蛋白(cAMP receptor protein,CRP) 也称为分解代谢物激活蛋白(catabolite activation protein,CAP)结合位点 当大肠杆菌生长在缺乏葡萄糖的培养基时,胞内cAMP升高,cAMP与CAP结合,所形成的复合物与CAP结合位点结合,从而激活gal,mal,lac等操纵子的启动子功能. AATGTGAG T T A G CTCACTCA TTACACTC A A T C GAGTGAGT 保守序列 对称轴 * (二) 终止子结构 终止子（terminator） 强终止子——不依赖ρ因子的终止子。 弱终止子——依赖ρ因子（rho factor）的终止子,依赖蛋白辅助因子才能实现终止作用. * 不依赖ρ因子的终止子 (1)有回文序列 (2)茎的区域富内含G-C； (3)3’端上有6个U 以上结构特点在终止中起何作用？ * 依赖ρ因子的转录终止 ρ因子的功能: NTP酶活性,解旋酶活性 序列特征: 终止序列有回文序列，但G-C很少，下游没有固定特征。 * 二、真核生物启动子 RNA聚合酶I 只有一种启动子类型 RNA聚合酶Ⅱ 启动子复杂 RNA聚合酶Ⅲ 启动子位于转录的DNA之内，称为下游启动子 真核生物中不同的RNA聚合酶识别不同的启动子： 真核生物中不同的基因由不同的RNA聚合酶识别不同的启动子转录. * (一). RNA Polymerase I 启动子 近启动子,–45~+20,也称核心启动子,决定转录起始精确位置; 上游启动子元件,-156~-107，可增加核心元件的转录起始的效率 Core element -100 UPE +1 +20 -45 rRNA启动子分为两个部分: * (二). RNA Polymerase II 启动子 Inr TATAA/TAT/T -25 +1 CCAAT box RNA Polymerase II 启动子 -75 * 1.起始子 Initiators（Inr） 转录的第一个碱基大多为A, 保守序列　PyPyANT/APyPy RNA Polymerase II 启动子 Note: A/T means either A or T 2. TATA box 保守序列 5’-TATAA/TAA/T, -30～-25. 相当于原核的-10序列,其作用是： a.选择正确的转录起始位点，保证精确起始，也称为选择子（selector）。 b.影响转录的效率 * RNA Polymerase II 启动子－－上游调控元件 3.CCAAT box GGC/TCAATCT，一般为-75附近 　作用:　控制转录起始的频率 * 4. 增强子Enhancers Enhancers are elements that stimulate transcription，一般在-100以上,又称远上游序列（far upstream sequence）。 ① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织的特异性。 ⑥ 有的增强子可以对外部信号产生反应。 增强子的特点: * (三). RNA Polymerase III 启动子 tRNA　gene 5SrRNA gene 带颜色的区域为启动子 * 启动子在基因内部 tRNA : box A,box B +1 A box B box Conservative sequences in A box 5’- TGGN/NAGTGG is the of D loop of tRNA; B box 5’- GGTTCGAN/NCC is the T?C loop of tRNA. * 5S rRNA : box A , box C a、5SrRNA是核糖体大亚单位的组成分，唯一独立分开转录的rRNA。 b、转录控制区boxC位于起始点下游80- 90bp处。 A box C box +1 * 关于真核生物RNA聚合酶、启动子