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2017-05-16 发布于上海
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EM-REML estimation of covariance parameters in Gaussian mixed models for longitudinal data analysis

Genet.Sel.Evol.32(2000)129–141 c INRA,EDPSciences 129 Original article EM-REML estimation of covariance parameters in Gaussian mixed models for longitudinal data analysis Jean-LouisFOULLEYa?,FlorenceJAFFR′EZICb, Christ`eleROBERT-GRANI′Ea a Stationdeg′en′etiquequantitativeetappliqu′ee, Institutnationaldelarechercheagronomique, 78352Jouy-en-JosasCedex,France b InstituteofCell,AnimalandPopulationBiology TheUniversityofEdinburgh EdinburghEH93JT,UK (Received24September1999;accepted30November1999) Abstract – This paper presents procedures for implementing the EM algorithm to compute REML estimates of variance covariance components in Gaussian mixed modelsforlongitudinaldataanalysis.Theclassofmodelsconsideredincludesrandom coe?cient factors, stationary time processes and measurement errors. The EM algorithm allows separation of the computations pertaining to parameters involved in the random coe?cient factors from those pertaining to the time processes and errors.TheproceduresareillustratedwithPotho?andRoy’sdataexampleongrowth measurements taken on 11 girls and 16 boys at four ages. Several variants and extensionsarediscussed. EMalgorithm/REML/mixedmodels /randomregression/longitudinaldata R′esum′e – Estimation EM-REML des param`etres de covariance en mod`eles mixtes gaussiens en vue de l’analyse de donn′ees longitudinales. Cet article pr′esente des proc′ed′es permettant de mettre en ?uvre l’algorithme EM en vue du calcul d’estimations REML des composantes de variance covariance en mod`eles mixtesgaussiensd’analysededonn′eeslongitudinales.Laclassedemod`elesconsid′er′ee concernelescoe?cientsal′eatoires,lesprocessustemporelsstationnairesetleserreurs de mesure. L’algorithme EM permet de dissocier formellement les calculs relatifs aux param`etres des coe?cients al′eatoires de ceux impliqu′es dans les processus et la r′esiduelle.Cesm′ethodes sontillustr′eesparunexempleprovenantdePotho?etRoy ? Correspondenceandreprints E-mail:foulley@jouy.inra.fr 130 J.-L.Foulleyetal.