蛋白质的基本单位.ppt

Amino acid, Protein, Enzyme, Coenzyme 胺基酸 (Amino acid) 胺基酸的分類 1.非極性或疏水性的R基群(Non-polar or hydrophobic R groups) 2.不帶電荷或親水性的R基群(Uncharged or hydrophilic R groups) 3.帶負電荷的R基群(Negatively charged R groups) 4.帶正電荷的R基群(Positively charged R groups ) 胺基酸的種類 胺基酸的種類 胺基酸的種類 胺基酸的種類 蛋白質的四級結構 四級結構(Quateruary Structure)：一些蛋白質由二個以上的peptide鏈(次單位)組成，代表蛋白質的整體結構。 三位一體密碼 (The triplet code) - mRNA與蛋白質的關係 三種RNA各有所司 1. 信使RNA (mRNA, messenger RNA) 用來傳遞 DNA 的遺傳訊息並作為蛋白質合的模板，佔RNA總量5%。 2. 核醣RNA (rRNA, ribosomal RNA) 用來將 mRNA 所攜帶的蛋白質胺基酸訊息序列，轉譯成相對應的胺基酸，佔 RNA 總量的15%。 3. 轉運RNA (tRNA, transfer RNA) 核糖體RNA，是組成核糖核蛋白的主要成份。 rRNA是構成核糖體的成份，且具有酵素活性，一些蛋白質會經過核孔進入細胞核，在核仁附近與rRNA結合成兩種次單元（大單元及小單元，若是真核生物其大單元為60S，小單元為40S），這兩個次單元會再次經過核孔離開細胞核，到達細胞質中並組合成為mRNA-核醣體複體 (mRNA-ribosomal complex)。 DNA-mRNA-Protein 一種新的胺基酸，命名為「對氨基苯丙氨酸 」（p-aminophenylalanine，簡稱pAF) 前加州La Jolla, Scripps研究中心，目前任職賓州Lancaster, Franklin Marshall學院的Ryan Mehl 博士就質疑：「為何生命只選定20個胺基酸？是否更多的胺基酸能產生更強勢的生物？在物競天擇的壓力下，能否更有效的適應環境？」 為了釐清問題，Mehl 博士與Scripps研究中心Peter Schultz 教授所領導的科學家團隊，利用大腸桿菌的生命代謝路徑，由簡單的碳素來源成功產生了一種新的胺基酸，並命名為「對氨基苯丙氨酸 」（p-aminophenylalanine，簡稱pAF)。 研究結果分析顯示，pAF在20種自然胺基酸的強力競爭下、依然能夠結合成新的蛋白質。 第21個胺基酸如何拼碼？如何併入蛋白質合成序列？ 該研究團隊將原本是蛋白質合成時、訊息RNA序列上，作為停止合成蛋白質指令的密碼，改換為非自然形成的第21種胺基酸，並建立了全新的蛋白質合成路徑。這項研究的特殊之處在於生物合成，這種細菌能自我合成新胺基酸，有別於從培養基供應的非自然形成胺基酸。 研究還發現，只需要鹽類及基本碳源，這種新創造出的細菌，便能進行後續演化功能，包括從合成新種胺基酸到組成新蛋白質，可謂是全新的非自然物種。 由於大腸桿菌長久以來便以快速增殖能力著稱，再加上細菌產生第21種胺基酸造成突變，難免使人們產生此種細菌變成強勢物種，造成失控及擴散的疑慮！ 為此，該研究團隊將此新物種的白胺酸（Leucine）生物合成能力破壞（白胺酸為20種必須胺基酸之一），如此便可控制這種細菌免於擴散實驗室之外、引發未知的後續問題。 酵素(Enzyme) 酵素的命名： 最初酵素命名並無法定規則，但都附有 -in 或 -zyme 等字尾，如trypsin，renin 及 lysozyme等；後來漸以該酵素催化的反應加上 -ase 字尾為名，再冠上此反應的反應物，如 histidine decarboxylase (反應物 + 反應-ase)。 全酶(Holoenzyme)的組成 輔酶(Coenzyme) 二十種胺基酸的基團中，不是屬於非極性者，就是相當溫和的酸性或鹼性機團，酵素活性區經常需要較強的官能基來引發催化反應，為補足此缺點，且增加酵素的反應能力，部份酵素因此納入蛋白質以外的輔助因子參與其構造，作為催化的重要反應基團。 輔助因子： 1.金屬離子：如Zn2+, Mg2+, Mn2+, Fe2+, Cu2+, K+，以離子鍵結合在 His, Cys, Glu等胺基酸。 2.有機小分子: 分子構造稍複雜而多樣又稱輔酶，如維生素B群、葉酸(folic acid)。 輔酶的作用： a.改變酵素構形, b. 協助催化反應, c.直接提供反應基團? 酵素的催化反應 酵素的活性區