二、蛋白质的分子结构(5-4-2).ppt

3. 结构域 (domain) 指多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区，它是相对独立的紧密球状实体，称为结构域（domain）或功能域。 三.蛋白质的超二级结构 酵母己糖激酶的三级结构 两个结构域之间有一个裂隙 3. 结构域 (domain) 三.蛋白质的超二级结构 A 结构域之间有一段肽链相连—铰链区 B 各个结构域可以相似或不相同 C 结构域一般为酶活性中心 四.蛋白质的三级结构 三级结构（tertiary structure）：指的是多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上，主链构象和侧链构象相互作用，进一步盘曲折叠形成球状分子结构。 （一）三级结构的概念 （二）球状蛋白的三级的结构特怔 具有三级结构的蛋白质分子含有多种二级结构单元。如具有三级结构的球状蛋白溶菌酶中含有?螺旋、?-折叠、?-转角和无规卷曲四种二级结构 四.蛋白质的三级结构 卵溶菌酶（egg lysozyme）的三级结构 （二）球状蛋白的三级的结构特怔 分子表面往往有一个内陷的空隙，它常常是蛋白质的活性中心 大多数非极性侧链埋在分子内部，形成疏水核；而极性侧链在分子表面，形成亲水面。 四.蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构具有明显的折叠层次。 4.4 蛋白质的分子结构 四级结构 三级结构 高级结构（空间结构） 二级结构 初级结构（共价结构） 一级结构 在二级结构和三级结构之间还有另一些层次，如超二级结构和结构域。 一. 蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构（primary structure）是指蛋白质肽链中氨基酸的排列顺序。而蛋白质的化学结构包括肽链数目、端基组成、氨基酸序列和二硫键的位置，又称共价结构。蛋白质的一级结构是最基本的结构，它决定着蛋白质高级结构。 一. 蛋白质的一级结构 以胰岛素为例，胰岛素是动物胰脏中胰岛β细胞分泌的一种分子量较小的激素蛋白，它的主要功能是降低体内血糖含量。临床上用来治疗糖尿病。 一. 蛋白质的一级结构 最先由Sanger于1953年完成测定胰岛素一级结构. 蛋白质的二级结构指多肽链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象。 （一）二级结构的概念 二. 蛋白质的二级结构 天然蛋白质包括α-螺旋、 β-折叠、 β-转角、 无规则卷曲等二级结构。 蛋白质分子的多肽链按一定方式折叠、盘绕或组装成特有的空间结构，亦称高级结构。蛋白质的高级结构即蛋白质的构象问题。 构型（configuration）是指不对称碳原子上相连的各原子或取代基团的空间排布（D-构型、L-构型）。构型的改变伴随着共价键的短裂和重新形成。 构型和构象 （一）二级结构的概念 二. 蛋白质的二级结构 构象（conformation）是指相同构型的化合物中，与碳原子相连的各原子或取代基团在单键旋转时形成的相对空间排布。 构象的改变不需要共价键的短裂和重新形成。 构型和构象 （一）二级结构的概念 二. 蛋白质的二级结构 X-射线衍射技术研究表明，肽键C-N键介于单键和双键之间，具有部分双键性质，不能自由旋转，其中绝大多数都形成刚性的酰胺平面结构。 蛋白质的构象 （一）二级结构的概念 二. 蛋白质的二级结构 酰胺平面 —— 由肽键周围的6个原子组成的刚性平面 — C — NH — O O Ca — C N — Ca H 键长介于单双键之间 O – — C NH — + 二. 蛋白质的二级结构 （二）酰胺平面 虽是单键却有双键性质 周边六个原子在同一平面上 前后两个a-carbon在对角(trans) C N C H a N C O C a 0.123nm 0.133nm 0.153nm 0.145nm 二. 蛋白质的二级结构 C--N 0.145 nm (正常) C=N 0.133 nm C=N 0.125 nm (正常) 因此，从理论上讲，蛋白质中的所有Cα- C单键和Cα- N单键都能自由旋转而形成无数变化的构象。 但事实上，一个天然蛋白质多态链在一定条件下只有一种或很少几种构象，而且相当稳定。 主要原因： 二. 蛋白质的二级结构 蛋白质的构象 （二）酰胺平面 1. 这是因为主链上由1/3具有部分双键性质的C-N键，不能自由旋转。 2. 此外主链上由很多R侧链，其大小及电荷情况各异。 3. 它们在单链旋转时产生空间位阻和静电效应，制约着大量的构象形成。 二. 蛋白质的二级