电子克隆9.pptVIP

与玉米6PGDH （AF061837）匹配的部分水稻ESTs 4. Os6PGDH 的克隆： EST contig 设计PCR引物 水稻各种组织 分别提取总RNA 合成cDNA第一链 水稻锌指蛋白氨基酸序列 搜索水稻基因组库 水稻锌指蛋白基因序列 PCR扩增 克隆 EST拼接 OsZFP基因家族的电子克隆流程图 3. OsZFP 基因家族的克隆： ? 3. OsZFP 基因家族的克隆： OsZFP家族 3. OsZFP 基因家族的克隆： 逐个对每个ZFP基因进行完整性分析 基因表达特性分析. 设计引物, PCR扩增. 有时难以确定5’端完整性： 序列比较 Kozak规则[A/GNNAUGG] 起始密码子上游的同阅读框序列中是否存在终止密码子 Northern杂交 RACE技术 4.电子克隆中最常见的问题及解决办法 有时候难以确定其表达的时期和条件： EST的表达时期(Unigene数据库、EST profile) 其他类似基因的表达时期 从多组织进行扩增（尤其是基因家族的分离） 查询GEO数据库 4.电子克隆中最常见的问题及解决办法 常用的序列数据库-- GenBank GenBank 包括了所有已公布的基因组、EST数据。 Nr 无冗余数据库（包括mRNA,DNA...） dbEST 数据库 GenBank提供的检索工具——BL