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- 2017-05-22 发布于广东
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生物化学课件第01章蛋白质的结构与功能12仁济护本
蛋白质的结构与功能 什么是蛋白质? 蛋白质的生物学重要性 分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。 含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45%,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80%。 蛋白质的分子组成The Molecular Component of Protein 组成蛋白质的元素 主要有C、H、O、N和 S。 有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘 。 蛋白质元素组成的特点 由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量: 二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸 存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属 L-α-氨基酸(甘氨酸除外)。 少数的蛋白质还存在一些上述20种基本氨基酸外的氨基酸: 如羟脯氨酸、羟赖氨酸、胱氨酸、四碘甲腺原氨酸(甲状腺素) 非蛋白质氨基酸:如β-丙氨酸、D-苯丙氨酸、同型半胱氨酸、瓜氨酸、 鸟氨酸等 三、氨基酸在蛋白质分子中的连接方式 人体内具有特殊生物活性的肽类,如: 蛋白质的分子结构The Molecular Structure of Protein 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,不涉及氨基酸残基侧链的构象 。 ①外观:右手螺旋(顺)。 ①肽段折纸状、锯齿状,相对伸展。 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 第一个氧分子与Fe2+结合 蛋白质空间结构的改变引起其功能的变化。 相邻2肽单元(肽键平面)的相对空间位置 Cα1 O H N Co ψ 酰胺平面-1 酰胺平面-2 O H N Co Cα3 Cα2 R H ? ?-螺旋 (? -helix) ?-折叠 (?-pleated sheet) ?-转角 (?-turn) 无规卷曲 (random coil) (二)蛋白质二级结构的主要构象 蛋白质二级结构 ?-螺旋结构要点: 1.?-螺旋 ( ? -helix ) ②螺距:3.6个氨基酸、0.54nm。 ③维持因素:氢键。 ④R基团的位置:螺旋外侧, R基团影响?-螺旋的形成。 ?-折叠结构要点: 2.?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ②几个肽段顺向平行、反向平行0.70nm。 ③维持因素:氢键。 ④R基团的位置:锯齿的上下方。 4个氨基酸残基 第二个常为脯氨酸 180?回折 氢键维持 ?-转角结构要点: 4.无规卷曲: 3.?-转角和无规卷曲 无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。 (三)模体 在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个有规则的二级结构组合,被称为超二级结构。 二级结构组合形式有3种:αα,βαβ,ββ 。 超二级结构 二个或三个二级结构 空间上靠近 特殊的构象 特殊的功能 模体(motif) 定义 举例 模体是具有特殊功能的超二级结构。 疏水键、离子键、氢键、 Van der Waals力等。 整条肽链 全部氨基酸 所有原子 什么是? 主要的化学键: 三维空间的位置排布 三、蛋白质的三级结构 (一)三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置 30k 40k 20k 75k 60k 35k 30k H2N- COOH A H2N- COOH B 肝素 纤维蛋白 肌动蛋白 细胞 胶原蛋白 纤维蛋白 肝素 纤维蛋白 纤连蛋白分子的结构域 举例 结构域: 三级结构中、分割成折叠较为紧密的区域,各行使其功能。 (二)结构域是三级结构层次上的局部折叠区 四级结构— 亚基 (subunit)— 维持因素— 各亚基的空间排布 亚基间相互作用关系 四级结构中每条具有完整三级结构的多肽链 离子键、氢键 不包括共价键 四、蛋白质的四级结构 由2个亚基组成的蛋白质四级结构中,若亚基分子结构相同,称之为同二聚体(homodimer),若亚基分子结构不同,则称之为异二聚体(heterodimer)。 血红蛋白的四级结构 定义 肽键 氨基酸残基 基本单位 主要键 备注 模体 肽单元 整条肽链 亚基 氢键 疏离氢Van 离氢 结构域 亚基 蛋白质结构层次比较 蛋白质结构与功能的关系 The Relation of Structure and Function of Protein 第三节 一、蛋白质一级结构是高级结构与功能的基础 (一)一级结构是空间构象的基础 (二)一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能 Ala Ile Ser Thr 马 Ala Val Ser
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