第02章基因组的结构与功能20100310.pptVIP

概念 顺反子 一、病毒基因组核酸的主要类型 二、病毒基因组结构与功能的特点 一、原核生物基因组结构与功能的特点 二、质粒  (一)概念 质粒与宿主细胞的关系 （1）质粒对宿主的生存不是必需的，只是“友好”的“借居”宿主细胞中，既不杀伤细胞，对宿主的代谢活动也无影响，宿主离开质粒照样的生存下去。 （2）质粒离开宿主就无法生存，只有依赖宿主细胞的（酶和蛋白质）帮助，才能完成自身的复制（扩增）、转录。 （3）质粒经常为宿主执行一些适当的遗传功能，作为对宿主细胞的补偿（“交房租”）。 （4）质粒赋于宿主各种有利的表型（质粒编码蛋白质或酶），使宿主获得生存优势，与我们基因工程实验紧密相关的，如抗生素抗性基因： Amp r 酶，水解β-内酰胺环,解除氨苄毒性,使细菌抗氨苄。 Tet r 膜蛋白,可阻止四环素进入细胞,使细菌抗四环素。 4.质粒发现和研究意义 1）理论意义 质粒能够复制、传递和表达遗传信息，从分子遗传学观点来看是一种有机体，是比病毒更原始的生命形式，是生命起源研究的一块重要基石。 2）实践意义 是基因工程的重要载体（vector），能把外源基因（目的基因）送到宿主细胞中去克隆扩增或克隆表达。 ①质粒是可以改造的，可以剪切、剪接的，基因工程的重要任务之一就是严格改造质粒的同时，控制质粒不传递，若一个致癌质粒可以传递就可能会传到外。 ②作为基因工程载体的3个特点： A.都能独立自主的复制； B.都能便利的加以检测（抗生素抗性）； C.都能容易引进宿主细胞中去，也易从宿主细胞中分离纯化（提质粒）。 质粒符合上述3个条件。 基因工程中主要使用人工构建的质粒。 (二)质粒的遗传控制 (三)质粒的类型 三、转位因子 (一)转位因子的类型及特征1. 插入序列 （1）IS是一类较小的转位因子，长度约700-2000bp，按发现顺序IS1、IS2…命名， 只携带转移的必需基因，不含有其它偏码蛋白质结构基因，本身没有表型效应。 （2）IS两侧为反向（倒转）重复顺序（16-41bp），中间为转位酶基因，在插入新的位点侧有3~116p顺向重复顺序（direct repeated sequence）,DR是靶位点序列复制的产物。 （3）IS到处活动，可以插入到E.coli染色体的各个位置上，也可以插入到质粒和某些噬菌体基因组上，甚至同一基因不同位点上。这种插入作用可以双向进行，可以是正向，也可以是反向插入IS这种移动方式称为转位作用（transposition）。 （4）在一个世代的107细菌中有1次插入。 *TR（反向倒转重复序列）GGAAGGT、、、ACCTTCC CCTTCCA、、、TGGAAGG *DR（正同向重复序列）：TACGTTACGT 2. 转座子3. 可转座的噬菌体 (二)转位因子的几个遗传效应 (三)转位作用的机制 四、细菌基因组学研究及意义 一、真核生物基因组的特点 二、真核生物基因组的结构  (一)结构基因 (二)顺式调控元件 1.启动子2.上游启动子元件 3.启动子4.增强子 5.加尾信号 (三)基因家族 (四)重复序列 (五)真核生物基因组中的转座子 (六)端粒 原核基因组、真核基因组、病毒基因组比较（供参考） 原核基因组 真核基因组 病毒基因组 1.生物学特征 类核、无核膜转录、翻译 有核膜,录在核,译在浆 DNA或RNA不共存1个V颗粒(一 同一个区间进行 般利用宿主机制转录、翻译) 2.染色体数目 单倍体 配子为单倍体、体细胞双倍体 单倍体、逆转录病毒除外 3.核酸分子结构 双链环状DNA分子 双链线型 以单链DNA，双链RNA突出 4.基因组大小 5000多个基因（E.coli） 5~10万（2.8万） 3~几百个 5.核酸类型 DNA DNA DNA或RNA 6.核酸数目 中（ ） 多（ ）